利用原癌基因/同源盒基因逆转录病毒人cDNA文库在小鼠体内模型中鉴定致白血病基因

数据集获取

源站：https://search.dataone.org/view/sha256%3A5be76e312655ee606014816ca12c224348dbab60733c485cc8005e54b892c2c0

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

本研究的目的是开发一种方法，利用逆转录病毒cDNA文库和小鼠骨髓转导-移植系统，筛选大量急性髓系白血病（AML）的潜在驱动突变。作为概念验证，小鼠骨髓（BM）细胞被转导了编码已知癌基因和同源盒基因的逆转录病毒cDNA文库，并将病毒转导的细胞移植到致死照射的小鼠体内。通过对白血病细胞中分离的基因组DNA进行cDNA插入片段的PCR扩增，鉴定了负责白血病起始的原癌基因。在十只白血病小鼠的初步筛选中，所有白血病小鼠中均检测到了MYC原癌基因。十只白血病小鼠中，有3只（30%）仅以MYC作为转基因，七只小鼠（70%）则具有额外的原癌基因插入。我们从文库中移除MYC相关基因后重复了相同的实验，以表征其他诱导白血病的基因组合。我们的…

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。