难治性儿童T细胞急性白血病中的非经典淋巴母细胞

我们的数据集包含来自两个儿童 T 细胞急性淋巴细胞白血病队列的 scRNA-seq 数据。对于第一个队列,我们对 13 名诱导失败(难治性疾病)儿童和 8 名对化疗有反应儿童的诊断期骨髓穿刺样本进行了测序

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基因组分类肿瘤白血病单细胞转录组骨髓血液胸水
A non-canonical lymphoblast in refractory childhood T-cell acute leukaemia

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-09

资源简介

难治性儿童T细胞急性白血病中的非经典淋巴母细胞

本数据集为单细胞转录组(scRNA-seq)数据集,来源于儿童 T 细胞急性淋巴细胞白血病(T-cell childhood acute lymphocytic leukemia)研究,聚焦于难治性(诱导失败)病例。数据集包含两个儿童患者队列:第一个队列对 13 名诱导失败(难治性疾病)儿童和 8 名对化疗有反应儿童的诊断期骨髓穿刺样本进行了测序,并对其中 8 名难治性患者在诱导失败后再次进行骨髓测序,共 29 个样本;第二个队列包含 37 名患者,其中 6 名诱导失败,用于验证第一个队列的发现。涉及组织包括血液、骨髓和胸腔积液,检测方法为 10x 5' v2。该数据集属于肿瘤/白血病分类,来源于 cellxgene.cziscience.com,主题标签为 T-cell childhood acute lymphocytic leukemia。

【数据集背景】

该数据集针对儿童 T 细胞急性淋巴细胞白血病(T-cell childhood acute lymphocytic leukemia)开展研究。T 细胞急性淋巴细胞白血病是儿童中常见的恶性血液肿瘤之一,其中部分患者对诱导化疗不敏感,表现为诱导失败或难治性疾病,临床预后较差。为深入理解这类难治性白血病的生物学特征,研究者利用单细胞 RNA 测序技术,对儿童患者的临床样本进行转录组分析。数据集英文名称为“A non-canonical lymphoblast in refractory childhood T-cell acute leukaemia”,提示研究关注难治性儿童 T 细胞急性白血病中一种非经典淋巴母细胞。该数据集所属分类为肿瘤/白血病,来源于 cellxgene.cziscience.com。

【数据内容】

数据集包含来自两个儿童 T 细胞急性淋巴细胞白血病队列的 scRNA-seq 数据。第一个队列中,研究者对 13 名诱导失败(难治性疾病)儿童和 8 名对化疗有反应儿童的诊断期骨髓穿刺样本进行了测序;对于其中 8 名难治性患者,还对其诱导失败后的骨髓样本进行了测序,第一个队列共计 29 个样本。第二个队列包含 37 名患者,其中 6 名诱导失败,用于验证第一个队列的发现。数据集涉及的组织类型包括血液、骨髓和胸腔积液。检测方法为 10x 5' v2。该数据集为单细胞数据集,托管于 CZ CELLxGENE。主题标签为 T-cell childhood acute lymphocytic leukemia。

【采集与来源】

该数据集来源于 cellxgene.cziscience.com。样本采集自儿童 T 细胞急性淋巴细胞白血病患者,包括诊断期骨髓穿刺样本以及部分难治性患者诱导失败后的骨髓样本。涉及组织为血液、骨髓和胸腔积液。检测平台为 10x 5' v2。关于样本采集的具体时间、地点、伦理审批信息以及患者招募细节,源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于儿童 T 细胞急性淋巴细胞白血病,尤其是难治性/诱导失败病例的单细胞转录组分析。潜在应用包括:比较诱导失败患者与化疗反应患者之间的细胞组成和转录组差异;研究难治性患者诱导失败前后骨髓样本中的细胞状态变化;验证第一个队列中发现的相关细胞群或分子特征;探索血液、骨髓和胸腔积液等不同组织中的白血病细胞异质性。该数据集也可作为儿童 T 细胞急性淋巴细胞白血病单细胞研究的参考数据,用于方法学比较或整合分析。关于具体的分析工具、流程或已验证的下游应用,源站未提供。

【使用方法】

该数据集为单细胞数据集,托管于 CZ CELLxGENE。用户可通过 cellxgene.cziscience.com 访问和下载。关于数据的具体下载格式、文件结构、是否提供预处理矩阵或原始测序数据、以及推荐的分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集基于 10x 5' v2 平台产生,包含两个队列,第一个队列 29 个样本,第二个队列 37 名患者。关于数据质量指标(如细胞数、基因数、测序深度、线粒体基因比例等)、批次效应、样本排除标准以及数据完整性评估,源站未提供。使用时应考虑队列间差异及样本来源的异质性。关于该数据集的具体限制和注意事项,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集来源于 cellxgene.cziscience.com。关于数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许商业用途等信息,源站未提供。

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      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

我们的数据集包含两个儿童T细胞急性淋巴细胞白血病队列的单细胞RNA测序数据。对于第一个队列,我们对13名诱导失败(难治性疾病)儿童和8名对化疗有反应儿童的诊断性骨髓穿刺样本进行了测序。对于8名难治性患者,我们还对其诱导失败后的骨髓进行了测序,共计29个样本。我们的第二个队列包括37名患者,其中6名诱导失败,用于验证我们从第一个队列中得到的发现。疾病:儿童T细胞急性淋巴细胞白血病。组织:血液、骨髓、胸腔积液。检测方法:10x 5‘ v2。单细胞数据集(CZ CELLxGENE)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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