嫌色细胞肾细胞癌蛋白质组分析

主题标签:肿瘤、肾癌、嫌色细胞肾细胞癌、蛋白质组。本数据集为肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。本数据集为肿瘤领域的蛋白质公开数据集,来源:google_dataset,主题涵盖肿瘤。

google_dataset
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蛋白质分类肿瘤肾癌嫌色细胞肾细胞癌蛋白质组
Proteome profilling of chromophobe renal cell carcinomas

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-11-08

资源简介

嫌色细胞肾细胞癌蛋白质组分析

Proteome profilling of chromophobe renal cell carcinomas 是一个面向肿瘤研究领域的公开蛋白质组数据集,聚焦于嫌色细胞肾细胞癌这一肾癌亚型。该数据集由 Yi Xiao 提交,收录于 EBI(欧洲生物信息研究所)的 PRIDE 蛋白质组学数据平台,项目编号为 PXD019123,可通过 https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD019123 访问。从主题上看,该数据集涵盖肿瘤、肾癌、嫌色细胞肾细胞癌与蛋白质组等关键词,属于肿瘤学与肾脏肿瘤研究交叉方向的数据资源,可为嫌色细胞肾细胞癌的蛋白质层面研究提供公开数据基础。

【数据集背景】

嫌色细胞肾细胞癌是肾细胞癌的一种组织学亚型,在临床与基础研究中受到持续关注。蛋白质组学研究通过对生物样本中蛋白质组成及丰度的系统检测,有助于刻画肿瘤的分子特征。该数据集以嫌色细胞肾细胞癌的蛋白质组分析为主题,属于肿瘤领域公开数据集,主题涵盖肿瘤。其来源站为 ebi.ac.uk,依托 PRIDE 归档平台对外发布。关于该数据集产生的具体研究背景、立项动机与科学问题,源站未提供。

【数据内容】

该数据集的主题标签包括肿瘤、肾癌、嫌色细胞肾细胞癌、蛋白质组,表明其内容围绕嫌色细胞肾细胞癌样本的蛋白质组展开。数据集英文名称为 Proteome profilling of chromophobe renal cell carcinomas。关于样本数量、蛋白质鉴定数量、定量结果、分组设计、文件格式与数据规模等具体内容,源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ebi.ac.uk,收录于 PRIDE 归档项目 PXD019123,提交者为 Yi Xiao。源站描述为“Yi Xiao, Proteome profilling of chromophobe renal cell carcinomas [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD019123”。关于样本采集方式、实验流程、仪器平台与数据处理流程等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于其主题范围,该数据集可服务于嫌色细胞肾细胞癌相关的蛋白质组研究,例如作为肿瘤分子特征分析的公开数据资源,或用于肾癌亚型间的比较研究参考。本站将其归类为肿瘤 / 肾癌。关于该数据集具体的适用分析类型与已验证的应用方向,源站未提供。

【使用方法】

该数据集可通过上述 PRIDE 项目页面获取。关于数据下载方式、文件组织说明、使用协议与配套分析工具等具体使用指引,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集为公开归档的蛋白质组数据集,其提交者与来源平台信息明确。关于数据质量评估指标、技术验证结果、样本代表性及使用中的已知限制,源站未提供。

【引用与许可】

引用该数据集时,可参考源站给出的描述信息:Yi Xiao, Proteome profilling of chromophobe renal cell carcinomas [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD019123。关于该数据集的具体许可条款与使用限制,源站未提供。

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数据集获取

源站:https://ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD019123

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  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

Yi Xiao, Proteome profilling of chromophobe renal cell carcinomas [Dataset]. https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD019123

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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