透明细胞肾癌甲基化到表达特征模型数据集

许多研究人员现在在研究一种疾病时可以获得多个高维分子和临床数据集。随着我们进入数据分析的多组学时代,需要新的方法来结合不同层次的数据(例如基因组和表观基因组层次),以充分利用这一机会

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基因组预测肿瘤肾癌多组学数据整合甲基化基因表达预后风险评分疾病靶点
Data from: A methylation-to-expression feature model for generating accurate prognostic risk scores and identifying disease targets in clear cell kidney cancer

基本信息

模态
基因组
大小
0.000295128 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Zero v1.0 Universal
创建/更新时间
2026-10-11

资源简介

透明细胞肾癌甲基化到表达特征模型数据集

许多研究人员现在在研究一种疾病时可以获得多个高维分子和临床数据集。随着我们进入数据分析的多组学时代,需要新的方法来结合不同层次的数据(例如基因组和表观基因组层次),以充分利用这一机会

Data from: A methylation-to-expression feature model for generating accurate prognostic risk scores and identifying disease targets in clear cell kidney cancer

【数据集背景】

源站首次发布:2017。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):许多研究人员现在在研究一种疾病时可以获得多个高维分子和临床数据集。随着我们进入数据分析的多组学时代,需要新的方法来结合不同层次的数据(例如基因组和表观基因组层次),以充分利用这一机会。在这项工作中,我们概述了一种多组学数据整合的新方法,它将分子和临床预测因子作为单一分析的一部分结合起来,为透明细胞肾细胞癌创建预后风险评分。该方法以多种方式整合数据,同时创建的模型相对容易解释且具有高水平性能。此外,所提出的数据整合过程本身捕捉了数据中代表高度疾病相关功能的关系。

【主题与分类】

主题标签:肿瘤、肾癌、多组学数据整合、甲基化、基因表达、预后风险评分、疾病靶点。本站分类:肿瘤/肾癌。

【获取与许可】

源站页面:https://datadryad.org/dataset/doi:10.5061/dryad.b1t61

使用许可:Creative Commons Zero v1.0 Universal。

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源站:https://doi.org/10.5061/dryad.b1t61

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    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 295.1 KB。

数据说明

如今,许多研究人员在研究一种疾病时,可以获得多个高维度的分子和临床数据集。随着我们进入数据分析的多组学时代,需要新的方法来整合不同层次的数据(例如基因组和表观基因组层面),以充分利用这一机遇。在这项工作中,我们概述了一种多组学数据整合的新方法,该方法将分子和临床预测因子作为单一分析的一部分结合起来,为透明细胞肾细胞癌创建预后风险评分。该方法以多种方式整合数据,同时创建的模型相对易于解释且具有高性能。此外,所提出的数据整合过程本身捕捉了数据中代表高度疾病相关功能的关系。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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