SAMD5在胆道树细胞类型与恶性肿瘤中的表达与定位

源站描述指出,胆管癌(CC)在胆道树不同部位具有异质性,存在 BTSC 与 LPC 两类候选干/祖细胞,而 SAMD5 在正常小鼠大胆管 PBG 中特异性表达

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2023-05-30 更新
浏览 3
其他分类bile ductSAMD 5LPCcholestatic liver diseasemotif domainbiliary epithelial cellscell cycle regulationbiliary tree Cholangiocarcinomabile ductsPBGcell typeCC cell lines
Expression and localization of sterile alpha motif domain containing 5 is associated with cell type and malignancy of biliary tree

基本信息

模态
其他
大小
0.002701444 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-30
版本
v1

资源简介

SAMD5在胆道树细胞类型与恶性肿瘤中的表达与定位

Expression and localization of sterile alpha motif domain containing 5 is associated with cell type and malignancy of biliary tree

该数据集来自 plos.figshare.com,配套论文发表于 PLOS ONE(2017 年),围绕 Sterile alpha motif domain containing 5(SAMD5)在胆道树中的表达与定位展开。源站描述指出,胆管癌(CC)在胆道树不同部位具有异质性,存在 BTSC 与 LPC 两类候选干/祖细胞,而 SAMD5 在正常小鼠大胆管 PBG 中特异性表达。数据集包含 6 个文件,以补充图与补充表形式呈现,可用于研究 SAMD5 与胆道细胞类型、胆管癌恶性程度及胆汁淤积性肝病模型的关系(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Expression and localization of sterile alpha motif domain containing 5 is associated with cell type and malignancy of biliary tree》发表于 PLOS ONE(2017),DOI:10.1371/journal.pone.0175355。源站首次发布:2017-04-07。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):胆管癌(CC)是腺癌中相对罕见的一种肿瘤。CC 以及胆道上皮细胞的特征在胆道树的不同部位具有异质性。胆道树存在两种候选干/祖细胞,即大胆管胆管周围腺体(PBG)中的胆道树干/祖细胞(BTSC)和外周小胆管 Hering 管中的肝干/祖细胞(LPC)。尽管既往报道提示肝内胆管癌(ICC)可起源于此类干/祖细胞,但 BTSC 与 LPC 在病理过程中的特征差异仍需进一步研究,且 CC 的病因学仍知之甚少。本研究表明,Sterile alpha motif domain containing 5(SAMD5)在正常小鼠大胆管的 PBG 中特异性表达。利用胆汁淤积性肝病小鼠模型……

【数据结构与技术规格】

文件数 6 个,合计 2.70 MB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0175355。

【主题与分类】

源站学科分类:Biophysics、Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology。主题标签:bile duct、SAMD 5、LPC、cholestatic liver disease、motif domain、biliary epithelial cells、cell cycle regulation、biliary tree Cholangiocarcinoma、bile ducts、PBG。本站分类:肿瘤/肝门胆管癌。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biophysics、Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Expression_and_localization_of_sterile_alpha_motif_domain_containing_5_is_associated_with_cell_type_and_malignancy_of_biliary_tree/4830883

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Yagai, Tomoki; Matsui, Satoshi; Harada, Kenichi; Inagaki, Fuyuki F.; Saijou, Eiko; Miura, Yasushi; et al. (2017). Expression and localization of sterile alpha motif domain containing 5 is associated with cell type and malignancy of biliary tree. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-30,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "S3 Fig.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/8021966"
curl -L -o "S4 Fig.tif" "https://ndownloader.figshare.com/files/8021990"
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curl -L -o "S1 Table.docx" "https://ndownloader.figshare.com/files/8021999"

文件清单

  • S1 Fig.tif(537.78 KB)
  • S2 Fig.tif(1.06 MB)
  • S3 Fig.tif(299.65 KB)
  • S4 Fig.tif(498.10 KB)
  • S5 Fig.tif(262.54 KB)
  • S1 Table.docx(42.70 KB)

文件总体积 2.70 MB(源站 API 实测)。

数据说明

胆管癌(CC)是腺癌中一种相对罕见的肿瘤类型。胆管癌及胆管上皮细胞的特征在胆管树的不同部位具有异质性。胆管树存在两种候选干/祖细胞,即大胆管胆管周围腺体(PBG)中的胆管树干/祖细胞(BTSC)和外周小胆管Hering管中的肝干/祖细胞(LPC)。尽管既往报道提示肝内胆管癌(ICC)可起源于此类干/祖细胞,但BTSC与LPC在病理过程中的特征差异仍需进一步研究,且胆管癌的病因学仍知之甚少。本研究表明,Sterile alpha motif domain containing 5(SAMD5)在正常小鼠大胆管的PBG中特异性表达。利用胆汁淤积性肝病小鼠模型,我们证实SAMD5表达在肝门部大胆管、肝外胆管及PBG中上调,而在增殖的肝内小胆管中并未上调,提示SAMD5表达于BTSC而非LPC。

有趣的是,人肝内胆管癌(ICC)和肝外胆管癌(extrahepatic CC)中SAMD5呈现显著的细胞核定位,而正常肝门部大胆管则表现为细胞质中轻度至中度表达。使用SAMD5 siRNA进行的体外实验显示,SAMD5表达与胆管癌细胞系的细胞周期调控相关。结论:SAMD5是小鼠PBG的新型标志物,而非LPC的标志物。在人类中,SAMD5的表达及定位可能成为鉴别胆管细胞类型及胆管癌恶性程度的有前景的诊断标志物。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0175355(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Expression_and_localization_of_sterile_alpha_motif_domain_containing_5_is_associated_with_cell_type_and_malignancy_of_biliary_tree/4830883)。

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