HCC监测队列中无HCC患者的系列血清AFP结果

该数据集来自HCC监测队列,收录无肝细胞癌患者的系列血清AFP检测结果,每位患者随时间多次采样,并以距最近一次采样的天数作为时间参照,同时提供相关临床信息

datashare_ed
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蛋白质预测Hepatocelluar carcinomaCancer screeningAlphafetoprotein
Serial serum AFP results for HCC free patients in HCC surveillance cohort

基本信息

模态
蛋白质
任务类型
预测
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

HCC监测队列中无HCC患者的系列血清AFP结果

该数据集名为“Serial serum AFP results for HCC free patients in HCC surveillance cohort”,来自英国爱丁堡大学的数据共享平台 datashare.ed.ac.uk,在站内归入肿瘤 / 肝细胞癌(HCC)分类。数据集聚焦于肝细胞癌监测场景,收录的是监测队列中未患肝细胞癌患者的系列血清甲胎蛋白(AFP)检测结果。每位患者随时间推移拥有多次AFP检测记录,数据以距最近一次采样的天数作为时间参照,并附带相关临床信息。该数据集的分析用途与一篇投稿至 PLOS ONE 的研究相关,且已获得当地伦理委员会批准存入公开可访问的存储库。整体而言,这是一份面向肝细胞癌筛查与监测研究的纵向血清标志物数据资源。

【数据集背景】

肝细胞癌是全球范围内常见的恶性肿瘤之一,早期发现对改善患者预后具有重要意义。在肝细胞癌监测与筛查实践中,血清甲胎蛋白(AFP)是常用的血液生物标志物之一,通过定期检测其浓度变化,可为临床评估提供参考。该数据集正是产生于肝细胞癌监测队列的背景之下,关注的对象是队列中未患肝细胞癌的患者,即所谓“HCC free”人群。对这一人群的系列AFP结果进行收集与分析,有助于理解在无肝癌状态下AFP随时间的变化特征,并为相关筛查策略的评估提供数据基础。数据集的分析工作与一篇投稿至 PLOS ONE 的研究论文相关,说明其具有明确的研究导向。

【数据内容】

数据集的核心内容是每位患者的系列血清AFP检测结果。所谓“系列”,意味着同一患者并非只有一次检测记录,而是在不同时间点多次采样,从而形成纵向的检测序列。数据中为每次检测提供了以天为单位的时间参照,该参照是相对于最近一次采样来计算的,这一设计使得各次采样之间的时间间隔和先后关系可以被明确表达。除AFP检测结果与时间参照外,数据集还提供相关的临床细节,用于辅助理解患者的背景情况。主题标签包括肝细胞癌、癌症筛查和甲胎蛋白,反映了数据内容所涉及的疾病领域、应用场景与检测指标。

【采集与来源】

该数据集来源于 datashare.ed.ac.uk,即爱丁堡大学的数据共享平台。根据源站描述,数据用于一项投稿至 PLOS ONE 的分析工作。当地伦理委员会已批准将该数据存入公开可访问的存储库,这表明数据的采集与公开共享经过了伦理审查程序。数据所涉及的样本为血清AFP检测结果,来自肝细胞癌监测队列中未患肝细胞癌的患者。关于具体的采集机构、采集时间跨度、样本量、检测方法等细节,源站未提供。

【适用场景】

基于数据内容,该数据集可适用于与肝细胞癌监测和筛查相关的研究场景,尤其是围绕血清甲胎蛋白纵向变化规律的分析。由于纳入对象均为未患肝细胞癌的患者,该数据可用于研究在无肝癌状态下AFP检测结果的分布与时间趋势,也可作为对照或背景数据,支持对筛查标志物表现的评估。主题标签中的“癌症筛查”与“甲胎蛋白”进一步指向其在筛查研究中的潜在用途。此外,附带的时间参照与临床信息,使得研究者能够将检测结果与时间维度及临床背景结合进行分析。关于该数据集在其他具体研究场景中的适用性,源站未提供。

【使用方法】

数据以患者为单位组织,每位患者包含一系列AFP检测结果,并配有相对于最近一次采样的天数参照。研究者在使用时,可依据该时间参照重建每位患者的检测时间序列,进而分析AFP随时间的变化。相关临床细节可用于分组、校正或描述性分析。由于数据涉及患者层面的纵向记录,使用时需注意以患者为分析单元,避免将同一患者的多次检测简单视为独立样本。关于具体的数据格式、字段结构、文件组织方式以及推荐的分析流程,源站未提供。

【质量与限制】

该数据集已获得当地伦理委员会批准存入公开可访问的存储库,且与投稿至 PLOS ONE 的分析工作相关,这在一定程度上反映了其来源的规范性与研究用途的明确性。数据聚焦于未患肝细胞癌的患者,因此其结论不宜直接推广至已患肝癌人群。时间参照以距最近一次采样的天数表示,使用者在解释时间信息时需理解这一参照方式。关于样本量、缺失情况、检测方法的标准化程度、随访时长以及可能存在的选择偏倚等具体质量指标,源站未提供。

【引用与许可】

该数据集托管于 datashare.ed.ac.uk,源站描述提及其与投稿至 PLOS ONE 的分析相关,并已获当地伦理委员会批准存入公开可访问的存储库。关于具体的引用格式、许可条款、使用限制或数据访问条件,源站未提供。使用者在引用或再利用该数据前,应自行查阅源站页面以获取准确的引用与许可信息。

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数据集获取

源站:https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/1991

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

用于分析的数据与提交至PLOS ONE的稿件相关。当地伦理委员会已批准将其存放于公开可访问的数据库中。每位患者均有一系列随时间采集的血清AFP结果。参考时间以天为单位,相对于最近一次样本给出。相关临床详情已提供。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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