胆管细胞癌与肝细胞癌细胞系中的线粒体DNA改变
该数据集包含胆管细胞癌和肝细胞癌细胞系的线粒体DNA突变数据,涵盖基因序列位置、参考核苷酸及蛋白质功能影响分析,数据模态为基因序列与临床注释表格,主要用于癌症基因组学、线粒体遗传变异研究及肿瘤生物标志物探索。

基本信息
资源简介
胆管细胞癌与肝细胞癌细胞系中的线粒体DNA改变
【数据集背景】
本数据集源站标题为《mtDNA alterations in Cholangiocellular Carcinoma (CCA) and Hepatocellular Carcinoma (HCC) Cell Lines.》。配套论文《Mitochondriome and Cholangiocellular Carcinoma》发表于 PLoS ONE(2014),DOI:10.1371/journal.pone.0104694。源站首次发布:2014-08-19。
【数据内容】
源站原始描述:Note: RCRS, Revised Cambridge Reference Sequence; both RCRS position and reference nucleotide at that specific position are designed as above. In particular, the highly specific MitoAnalyzer tool ( was used for determining the effect of base substitution on translated protein sequence. The bold base positions are recurrent alterations present in all CCA and HCC cell lines and hepatocyte cell line
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 26.11 KB。Table_2.xls:application/vnd.ms-excel,26.11 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0104694.t002。
【主题与分类】
源站学科分类:Biological Sciences。主题标签:nad、hepatocyte cell line、oxphos、assay、oz、pcr、CCA cell lines、THLE、Confocal laser microscopy、mtDNA copy number。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Biological Sciences。
【获取与许可】
源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/_mtDNA_alterations_in_Cholangiocellular_Carcinoma_CCA_and_Hepatocellular_Carcinoma_HCC_Cell_Lines_/1145024
使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。
规范引用:Bahitham, Wesam; Liao, Xiaoping; Peng, Fred; Bamforth, Fiona; Chan, Alicia; Mason, Andrew; et al. (2015). mtDNA alterations in Cholangiocellular Carcinoma (CCA) and Hepatocellular Carcinoma (HCC) Cell Lines.. PLOS ONE. Dataset
【使用注意】
· 源站最后修改于 2023-06-01,引用时请注意版本时效。
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集记录了胆管细胞癌(CCA)和肝细胞癌(HCC)细胞系中的线粒体DNA(mtDNA)突变信息。数据集包含基于修订剑桥参考序列(RCRS)的突变位置、参考核苷酸及其对翻译蛋白质序列的影响分析,其中使用MitoAnalyzer工具评估碱基替换对蛋白质功能的影响。数据突出展示了在CCA、HCC细胞系及肝细胞系中普遍存在的重复性突变位点。该数据集适用于癌症基因组学、线粒体遗传学及肿瘤生物标志物研究。
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