IDC VAREPOP-APOLLO 肿瘤影像数据集

癌症类型:食管癌、头颈部鳞状细胞癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌、其他肺癌、胰腺腺癌、胸腺瘤、结肠腺癌。肿瘤位置:食管、头颈、肺、胰腺、直肠、胸腺

idc
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基因组分类食管癌头颈部鳞状细胞癌肺腺癌肺鳞状细胞癌胰腺腺癌胸腺瘤结肠腺癌
IDC VAREPOP-APOLLO

基本信息

模态
基因组
任务类型
分类
创建/更新时间
2026-10-07

资源简介

IDC VAREPOP-APOLLO 肿瘤影像数据集

IDC VAREPOP-APOLLO 是一个收录于影像数据共享平台的数据集,本站将其归类于肿瘤 / 头颈部癌方向。该数据集汇集了来自“精准肿瘤学研究计划”(Research for Precision Oncology Program,RePOP)网络的研究对象,这一研究活动建立了一个由确诊癌症的退伍军人组成的队列,并作为标准诊疗的一部分对其肿瘤组织进行了基因组分析。数据集共包含 41 名受试者,覆盖食管癌、头颈部鳞状细胞癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌、其他肺癌、胰腺腺癌、胸腺瘤以及结肠腺癌等多种癌症类型,肿瘤位置涉及食管、头颈、肺、胰腺、直肠和胸腺。围绕患者的癌症及诊疗过程,相关数据被统一收集,涵盖人口统计学信息、合并症、基因组分析、治疗、用药、实验室检查值、影像学检查以及结局等多方面内容。

【数据集背景】

该数据集来源于 IDC 平台的 VAREPOP-APOLLO 集合,其背后的研究基础是 RePOP 网络。RePOP 是一项研究活动,建立了一个由确诊癌症的退伍军人组成的队列,并对他们的肿瘤组织开展了基因组分析,这一分析属于标准诊疗的组成部分。数据集所涉及的癌症类型较为多样,包括食管癌、头颈部鳞状细胞癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌、其他肺癌、胰腺腺癌、胸腺瘤和结肠腺癌。肿瘤位置则涵盖食管、头颈、肺、胰腺、直肠和胸腺。这些信息共同勾勒出该数据集在肿瘤类型与解剖部位上的覆盖范围。

【数据内容】

数据集共包含 41 名受试者。围绕每位患者的癌症及癌症诊疗过程,收集的数据范围包括人口统计学信息、合并症、基因组分析、治疗、用药、实验室检查值、影像学检查以及结局。就癌症类型而言,涵盖食管癌、头颈部鳞状细胞癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌、其他肺癌、胰腺腺癌、胸腺瘤和结肠腺癌;就肿瘤位置而言,涉及食管、头颈、肺、胰腺、直肠和胸腺。上述内容构成了该数据集在临床与影像层面的主要信息组成。

【采集与来源】

该数据集来自 portal.imaging.datacommons.cancer.gov,为 IDC 平台上的 VAREPOP-APOLLO 集合。其受试者来自 RePOP 网络所建立的退伍军人癌症患者队列。相关数据是在 RePOP 项目下,围绕患者癌症及癌症诊疗过程收集的。关于影像部分的更多信息,可参阅 VAREPOP-APOLLO 页面(https://doi.org/10.7937/GHKN-MD15)。除上述来源信息外,源站未提供更细化的采集流程说明。

【适用场景】

基于其覆盖的多种癌症类型与肿瘤位置,以及包含基因组分析、治疗、用药、实验室检查值、影像学检查和结局等在内的数据范围,该数据集可用于与食管癌、头颈部鳞状细胞癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌、其他肺癌、胰腺腺癌、胸腺瘤和结肠腺癌相关的研究场景。由于数据围绕退伍军人癌症队列的诊疗全过程收集,也可用于涉及人口统计学、合并症、治疗与结局等维度的分析。源站未提供更具体的适用场景说明。

【使用方法】

源站未提供该数据集的具体使用方法。

【质量与限制】

源站未提供关于该数据集质量与限制的说明。

【引用与许可】

如需了解该数据集的更多信息,可参阅 VAREPOP-APOLLO 页面(https://doi.org/10.7937/GHKN-MD15)。源站未提供关于引用格式与许可条款的具体说明。

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使用方式

数据集获取

源站:https://portal.imaging.datacommons.cancer.gov/explore/filters?collection_id=varepop_apollo

标准获取流程:

  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

IDC 数据集 VAREPOP-APOLLO。癌症类型:食管癌、头颈部鳞状细胞癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌、其他肺癌、胰腺腺癌、胸腺瘤、结肠腺癌。肿瘤位置:食管、头颈部、肺、胰腺、直肠、胸腺。受试者:41 例。本数据集包含来自精准肿瘤学研究项目(RePOP)网络的受试者,该项目建立了一个被诊断患有癌症的退伍军人队列,并作为标准治疗的一部分对其肿瘤组织进行了基因组分析。与患者癌症及癌症治疗相关的所有数据均在 RePOP 下收集,包括患者人口统计学信息、合并症、基因组分析、治疗、药物、实验室检查值、影像学研究和结局。请参阅 VAREPOP-APOLLO(https://doi.org/10.7937/GHKN-MD15)页面,以了解有关图像的更多信息并获取本数据集的任何支持性元数据。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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