IDC VAREPOP-APOLLO 肿瘤影像数据集
癌症类型:食管癌、头颈部鳞状细胞癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌、其他肺癌、胰腺腺癌、胸腺瘤、结肠腺癌。肿瘤位置:食管、头颈、肺、胰腺、直肠、胸腺

基本信息
资源简介
IDC VAREPOP-APOLLO 肿瘤影像数据集
IDC VAREPOP-APOLLO 是一个收录于影像数据共享平台的数据集,本站将其归类于肿瘤 / 头颈部癌方向。该数据集汇集了来自“精准肿瘤学研究计划”(Research for Precision Oncology Program,RePOP)网络的研究对象,这一研究活动建立了一个由确诊癌症的退伍军人组成的队列,并作为标准诊疗的一部分对其肿瘤组织进行了基因组分析。数据集共包含 41 名受试者,覆盖食管癌、头颈部鳞状细胞癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌、其他肺癌、胰腺腺癌、胸腺瘤以及结肠腺癌等多种癌症类型,肿瘤位置涉及食管、头颈、肺、胰腺、直肠和胸腺。围绕患者的癌症及诊疗过程,相关数据被统一收集,涵盖人口统计学信息、合并症、基因组分析、治疗、用药、实验室检查值、影像学检查以及结局等多方面内容。
【数据集背景】
该数据集来源于 IDC 平台的 VAREPOP-APOLLO 集合,其背后的研究基础是 RePOP 网络。RePOP 是一项研究活动,建立了一个由确诊癌症的退伍军人组成的队列,并对他们的肿瘤组织开展了基因组分析,这一分析属于标准诊疗的组成部分。数据集所涉及的癌症类型较为多样,包括食管癌、头颈部鳞状细胞癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌、其他肺癌、胰腺腺癌、胸腺瘤和结肠腺癌。肿瘤位置则涵盖食管、头颈、肺、胰腺、直肠和胸腺。这些信息共同勾勒出该数据集在肿瘤类型与解剖部位上的覆盖范围。
【数据内容】
数据集共包含 41 名受试者。围绕每位患者的癌症及癌症诊疗过程,收集的数据范围包括人口统计学信息、合并症、基因组分析、治疗、用药、实验室检查值、影像学检查以及结局。就癌症类型而言,涵盖食管癌、头颈部鳞状细胞癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌、其他肺癌、胰腺腺癌、胸腺瘤和结肠腺癌;就肿瘤位置而言,涉及食管、头颈、肺、胰腺、直肠和胸腺。上述内容构成了该数据集在临床与影像层面的主要信息组成。
【采集与来源】
该数据集来自 portal.imaging.datacommons.cancer.gov,为 IDC 平台上的 VAREPOP-APOLLO 集合。其受试者来自 RePOP 网络所建立的退伍军人癌症患者队列。相关数据是在 RePOP 项目下,围绕患者癌症及癌症诊疗过程收集的。关于影像部分的更多信息,可参阅 VAREPOP-APOLLO 页面(https://doi.org/10.7937/GHKN-MD15)。除上述来源信息外,源站未提供更细化的采集流程说明。
【适用场景】
基于其覆盖的多种癌症类型与肿瘤位置,以及包含基因组分析、治疗、用药、实验室检查值、影像学检查和结局等在内的数据范围,该数据集可用于与食管癌、头颈部鳞状细胞癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌、其他肺癌、胰腺腺癌、胸腺瘤和结肠腺癌相关的研究场景。由于数据围绕退伍军人癌症队列的诊疗全过程收集,也可用于涉及人口统计学、合并症、治疗与结局等维度的分析。源站未提供更具体的适用场景说明。
【使用方法】
源站未提供该数据集的具体使用方法。
【质量与限制】
源站未提供关于该数据集质量与限制的说明。
【引用与许可】
如需了解该数据集的更多信息,可参阅 VAREPOP-APOLLO 页面(https://doi.org/10.7937/GHKN-MD15)。源站未提供关于引用格式与许可条款的具体说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://portal.imaging.datacommons.cancer.gov/explore/filters?collection_id=varepop_apollo
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
IDC 数据集 VAREPOP-APOLLO。癌症类型:食管癌、头颈部鳞状细胞癌、肺腺癌、肺鳞状细胞癌、其他肺癌、胰腺腺癌、胸腺瘤、结肠腺癌。肿瘤位置:食管、头颈部、肺、胰腺、直肠、胸腺。受试者:41 例。本数据集包含来自精准肿瘤学研究项目(RePOP)网络的受试者,该项目建立了一个被诊断患有癌症的退伍军人队列,并作为标准治疗的一部分对其肿瘤组织进行了基因组分析。与患者癌症及癌症治疗相关的所有数据均在 RePOP 下收集,包括患者人口统计学信息、合并症、基因组分析、治疗、药物、实验室检查值、影像学研究和结局。请参阅 VAREPOP-APOLLO(https://doi.org/10.7937/GHKN-MD15)页面,以了解有关图像的更多信息并获取本数据集的任何支持性元数据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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