头颈部放射组学数据集 HN1

该数据集包含 137 例头颈部鳞状细胞癌患者的临床数据及治疗前 CT 影像模态,其中肿瘤体积已由专家手动勾画,并提取了 440 个放射组学特征,用于量化肿瘤表型、评估预后及探索与基因表达模式的关联,主要支持放射组学在癌症影像分析、预后预测及转化医学中的研究与应用。

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2020-07-29 更新
浏览 37
Head and Neck Cancer
HEAD-NECK-RADIOMICS-HN1

基本信息

许可
CC BY-NC 3.0
创建/更新时间
2020-07-29
版本
Complete

资源简介

头颈部放射组学数据集 HN1

【一句话概览】

本数据集是 TCIA 公开数据集,收录 合计 11.79 GB、137 例受试者,主题涵盖 Head and Neck Cancer,源站分类为 CT、SEG、RTSTRUCT、PT,CC BY-NC 3.0 许可开放获取。

【数据集背景】

本数据集源站标题为《HEAD-NECK-RADIOMICS-HN1》。源站首次发布:2020/07/29。

【数据内容】

源站原始描述:Radiomics refers to the comprehensive quantification of tumor phenotypes by applying a large number of quantitative image features. In the published analysis, 440 features quantifying tumor image intensity, shape, and texture were extracted. We found that a large number of radiomic features have prognostic power in independent data sets, many of which were not identified as significant before. Radiogenomics analysis revealed that a prognostic radiomic signature, capturing intra-tumor heterogenei…

【数据结构与技术规格】

数据集 DOI:10.7937/tcia.2019.8kap372n。

【主题与分类】

源站学科分类:CT、SEG、RTSTRUCT、PT、Demographic、Follow-Up。主题标签:Head and Neck Cancer。

【适用方向】

源站学科分类标注为 CT、SEG、RTSTRUCT、PT、Demographic、Follow-Up。

【获取与许可】

源站页面:https://www.cancerimagingarchive.net/collection/head-neck-radiomics-hn1/

使用许可:CC BY-NC 3.0(https://creativecommons.org/licenses/by-nc/3.0/)。

规范引用:Wee, L., & Dekker, A. (2019). Data from HEAD-NECK-RADIOMICS-HN1 [Data set]. The Cancer Imaging Archive

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使用方式

数据集获取(TCIA 标准方式)

方式一:NBIA 搜索

  1. 打开 NBIA 搜索页(免费注册 TCIA 账号);
  2. 按本数据集 Collection 名称筛选(见源站页面),加入 Download Basket;
  3. 用 NBIA Download Manager 批量下载 DICOM。

方式二:NBIA API(程序化)

curl -s "https://services.cancerimagingarchive.net/nbia-api/services/v1/getSeries?Collection=COLLECTION_NAME" -o series.json

方式三:TCIA Manifest + dicomsort

在 Collection 页面下载 .tcia manifest 文件后用 NBIA CLI 下载。

数据说明

该数据集包含 137 名接受放射治疗的头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)患者的临床数据与计算机断层扫描(CT)影像。每位患者治疗前的 CT 影像由经验丰富的放射肿瘤科医生手动勾画了肿瘤大体体积(GTV)的三维轮廓。数据来源于《自然·通讯》发表的研究中使用的“H&N1”数据集,采用放射组学方法,从 CT 影像中提取了 440 个量化肿瘤强度、形状和纹理的特征,用于分析肿瘤表型、预后评估及与基因表达模式的关联。该数据集旨在支持放射组学研究的可重复性与可再现性,并遵循 FAIR 原则促进数据透明、标准化与协作。

数据加载示例(DICOM 影像)

import pydicom, glob, os
files = glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.dcm"), recursive=True)
d = pydicom.dcmread(files[0])
print("Modality:", d.Modality)
img = d.pixel_array

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