胶质瘤RNA测序数据VISA评分生成

该数据集包含胶质瘤的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,属于转录组模态,通过整合细胞外基质和细胞收缩力相关基因表达,构建虚拟刚度算法(VISA)以推断组织硬度,主要用于胶质瘤的病理机制研究、组织硬度生物信息学预测及肿瘤微环境分析。

Zenodo
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2023-07-24 更新
胶质瘤生物信息学组织硬度预测
创建时间2023-07-24
更新时间2023-07-24
原始链接

https://zenodo.org/record/8154966

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资源简介

该数据集旨在利用胶质瘤的RNA测序数据,通过分析细胞外基质(ECM)和细胞收缩力相关基因表达,构建一个名为虚拟刚度算法(VISA)的生物信息学工具,用于推断组织硬度。数据集包含胶质瘤的批量RNA测序和单细胞RNA测序数据,通过整合转录组信息与ECM蛋白、交联酶及细胞收缩力基因表达,为研究胶质瘤的病理机制提供数据支持。主要应用于胶质瘤的转录组分析、组织硬度预测以及肿瘤微环境研究。

提供机构:Zenodo

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影像Generating VISA scores on glioma bulk RNAseq and single cell RNAseq glioma