UCSD-PTGBM 数据集

加州大学圣地亚哥分校发布的术后高级别胶质瘤多模态MRI数据集,含243个时间点、178名受试者的影像和临床信息。

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DataCite Commons
2026-03-13 更新
浏览 34
多模态高级别胶质瘤多模态MRI
The University of California San Diego annotated post-treatment high-grade glioma multimodal MRI dataset (UCSD-PTGBM)

基本信息

模态
多模态
创建/更新时间
2026-03-13

资源简介

尽管目前公开可用的高级别胶质瘤术前磁共振成像(MRI)数据集数量日益增多,但术后可用的同类数据集却极为匮乏。本文特此发布加利福尼亚大学圣地亚哥分校术后高级别胶质瘤多模态磁共振成像(UCSD-PTGBM)数据集。该数据集涵盖178名受试者的243个时间点数据:受试者平均年龄为56±13岁(标准差),其中男性116例、女性62例;所有受试者均经组织病理学确诊为高级别胶质瘤,并在3特斯拉磁共振成像扫描仪上采用先进脑肿瘤成像协议完成扫描。成像序列包含标准三维成像、多壳层扩散成像与灌注成像技术(动脉自旋标记(ASL)、动态磁敏感对比成像(DSC)),同时包含经神经放射学家认可的逐体素肿瘤分割结果。此外,该数据集还收录了部分病例的异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变状态、O6-甲基鸟嘌呤-DNA甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化状态,以及总生存期与无进展生存期信息。我们期望全球研究者能够利用本数据集,进一步优化高级别胶质瘤患者术后磁共振成像的分析工作。

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使用方式

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方式一:NBIA 搜索

  1. 打开 NBIA 搜索页(免费注册 TCIA 账号);
  2. 按本数据集 Collection 名称筛选(见源站页面),加入 Download Basket;
  3. 用 NBIA Download Manager 批量下载 DICOM。

方式二:NBIA API(程序化)

curl -s "https://services.cancerimagingarchive.net/nbia-api/services/v1/getSeries?Collection=COLLECTION_NAME" -o series.json

方式三:TCIA Manifest + dicomsort

在 Collection 页面下载 .tcia manifest 文件后用 NBIA CLI 下载。

数据加载示例(DICOM 影像)

import pydicom, glob, os
files = glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.dcm"), recursive=True)
d = pydicom.dcmread(files[0])
print("Modality:", d.Modality)
img = d.pixel_array

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