IL-6介导胶质母细胞瘤微环境免疫抑制与治疗抵抗
该数据集包含人类和小鼠胶质母细胞瘤样本的质谱流式细胞术、单细胞分析、空间分析等多模态数据,记录了B细胞、T细胞、树突状细胞等多种免疫细胞频率,主要用于研究IL-6介导的肿瘤免疫微环境免疫抑制机制,探索通过中和IL-6或联合免疫检查点抑制剂与放疗来克服胶质母细胞瘤治疗抵抗的策略,为肿瘤免疫治疗提供实验依据。

基本信息
资源简介
IL-6介导胶质母细胞瘤微环境免疫抑制与治疗抵抗
【数据集背景】
本数据集源站标题为《IL-6 underlies microenvironment immunosuppression and resistance to therapy in glioblastoma》。
【数据内容】
源站原始描述:The glioblastoma tumor immune microenvironment (TIME) is an immunosuppressive barrier to therapy that encumbers glioblastoma responses to immune checkpoint inhibition (ICI). Immunosuppressive cytokines, pro-tumor macrophages and myeloid cells, and exhausted T-cells are hallmarks of the glioblastoma TIME. Here we integrate spatial and single-cell analyses of patient-matched human glioblastoma samples before and after ICI with genetic, immunologic, single-cell, and therapeutic studies in preclinic…
【主题与分类】
主题标签:IL-6、Mass cytometry、glioblastoma。
【获取与许可】
源站页面:https://search.dataone.org/view/sha256:42150119af7962d84d751b494c9eff92b0f25d65740ff03caf30fadd0dc322ff
下载信息
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- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集聚焦于胶质母细胞瘤(glioblastoma)肿瘤免疫微环境(TIME)中免疫抑制机制与治疗抵抗的关系,特别是白细胞介素-6(IL-6)在其中的关键作用。数据集包含来自患者匹配的人类胶质母细胞瘤样本(免疫检查点抑制剂治疗前后)以及临床前小鼠模型(如GL261和SB28)的多种数据,具体包括质谱流式细胞术(mass cytometry)数据、单细胞分析数据、空间分析数据以及遗传和免疫学相关数据。数据文件(如Fig4c_d_tumor.csv)记录了不同细胞类型的频率信息,如B细胞、CD4+ T细胞、CD8+ T细胞、树突状细胞、γδ T细胞、小胶质细胞、单核/巨噬细胞等。该数据集旨在研究IL-6如何驱动免疫抑制微环境,以及通过中和IL-6或联合免疫治疗(如免疫检查点抑制剂和放疗)能否改善胶质母细胞瘤的治疗反应,为肿瘤免疫治疗研究提供重要资源。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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