耐药胶质母细胞瘤亚型特异性脆弱性识别:用于生物标志物和药物发现的计算流程数据集
该数据集是一个针对耐药胶质母细胞瘤(GBM)的多模态研究数据集,主要包含来自Ivy GBM图谱计划的基因表达谱、生物标志物(如PDGFRA、FAP、CD163)的亚型特异性分析结果、患者生存分析数据,以及一个基于PDGFRA靶点的定量构效关系(QSAR)药物发现模型。其主要用途是深入解析GBM耐药的分子景观,为特定亚型GBM提供精准的生物标志物,并辅助通过计算流程进行新型抗肿瘤药物的理性设计与发现。

基本信息
资源简介
耐药胶质母细胞瘤亚型特异性脆弱性识别:用于生物标志物和药物发现的计算流程数据集
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Identification
of Subtype-Specific Vulnerabilities
in Resistant Glioblastoma: A Computational Pipeline for Biomarkers
and Drug Discovery》。配套论文《Identification of Subtype-Specific Vulnerabilities in Resistant Glioblastoma: A Computational Pipeline for Biomarkers and Drug Discovery》发表于 Molecular Pharmaceutics(2025),DOI:10.1021/acs.molpharmaceut.5c01538。源站首次发布:2025-12-03。
【数据内容】
源站原始描述:Therapeutic resistance in glioblastoma (GBM) remains a critical clinical challenge. To better understand its molecular basis, we performed a multistage computational analysis on a resistant GBM data set derived from the Ivy Glioblastoma Atlas Project, filtered for unmethylated MGMT and EGFR amplification. A subtype-specificity analysis identified distinct expression patterns for established biomarkers, including PDGFRA, FAP, and CD163, providing refined context for their roles in specific GBM su…
【数据结构与技术规格】
文件数 1 个,合计 43.42 MB。数据集 DOI:10.1021/acs.molpharmaceut.5c01538.s002。
【主题与分类】
源站学科分类:Cell Biology、Genetics、Neuroscience、Pharmacology、Biotechnology、Biological Sciences not elsewhere classified。主题标签:providing refined context、potential new inhibitors、novel lead compound、integrated bioinformatic pipelines、high predicted potency、critical clinical challenge、multistage computational analysis、model targeting pdgfra、specific gbm subtypes、specific vulnerabilities。
【适用方向】
源站学科分类标注为 Cell Biology、Genetics、Neuroscience、Pharmacology、Biotechnology、Biological Sciences not elsewhere classified。
【获取与许可】
源站页面:https://acs.figshare.com/articles/dataset/Identification_of_Subtype-Specific_Vulnerabilities_in_Resistant_Glioblastoma_A_Computational_Pipeline_for_Biomarkers_and_Drug_Discovery/30773455
使用许可:CC BY-NC 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/)。
规范引用:Lopez-Parra, Johan Sebastian; Hameedat, Fatima; Sousa, Sérgio F.; Walenkamp, Annemiek M. E.; Sousa, Flávia; A Santos, Hélder (2025). Identification of Subtype-Specific Vulnerabilities in Resistant Glioblastoma: A Computational Pipeline for Biomarkers and Drug Discovery. ACS Publications. Dataset
下载信息
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使用方式
数据集获取(Figshare)
按页面 Download 按钮获取。
数据说明
该数据集来源于Ivy胶质母细胞瘤图谱计划,针对具有未甲基化MGMT和EGFR扩增特征的耐药胶质母细胞瘤(GBM)患者样本进行多阶段计算分析。数据集内容包括:1)耐药GBM的基因表达谱数据;2)亚型特异性分析结果,揭示了PDGFRA、FAP、CD163等关键生物标志物在不同GBM亚型中的表达模式;3)生存分析结果,显示高PDGFRA表达与患者不良预后相关;4)针对PDGFRA靶点的定量构效关系(QSAR)模型及通过该模型在计算机中识别出的新型先导化合物(基于噻唑并吡啶支架)。该数据集主要用于研究GBM耐药的分子机制、发现亚型特异性生物标志物、以及辅助基于结构的抗GBM药物理性设计。
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