全蛋白质组噬菌体免疫沉淀测序揭示生殖细胞肿瘤特异性免疫特征

该数据集包含427份血清样本(150例生殖细胞肿瘤患者和277例对照),基于噬菌体免疫沉淀测序(PhIP-Seq)技术,通过全蛋白质组筛选构建了针对生殖细胞肿瘤的血清免疫特征面板(GCT-iSIGN和Sem-iSIGN),整合了RNA测序、ELISA及免疫组化验证数据,主要应用于生殖细胞肿瘤的生物标志物发现、诊断辅助及肿瘤分型研究。

Zenodo
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2025-11-19 更新
创建时间2025-10-30
更新时间2025-11-19
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https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.17478532

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资源简介

该数据集基于噬菌体免疫沉淀测序(PhIP-Seq)技术,旨在开发用于生殖细胞肿瘤(GCTs)诊断和分型的血清免疫特征面板。数据集包含427份血清样本(150例GCT患者,277例对照),通过全蛋白质组筛选,构建了包含16个独特蛋白的24个肽段的GCT-iSIGN免疫特征面板,其灵敏度达93%,特异性达99%,曲线下面积(AUC)为0.98。此外,还构建了用于区分精原细胞瘤与非精原细胞瘤的Sem-iSIGN次级模型(包含5个蛋白的17个肽段)。数据整合了来自癌症基因组图谱(TCGA)的RNA测序结果以及ELISA和免疫组化验证数据,证实了目标抗原(如ERVK7、LUZP4等)在肿瘤组织中的差异表达。该数据集为生殖细胞肿瘤提供了高灵敏度、高特异性的血清生物标志物面板,可用于辅助诊断、分型及临床管理研究。

提供机构:Zenodo

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影像Whole-proteome phage immunoprecipitation sequencing reveals germ cell tumor–specific immunosignature