滤泡性淋巴瘤相关VMA21基因突变激活自噬依赖性数据集

该数据集整合了滤泡性淋巴瘤患者的基因突变数据、细胞自噬活性测量结果、溶酶体代谢组学分析及药物筛选数据,涵盖基因序列、蛋白质表达、代谢物浓度和药物反应等多种模态信息,主要用于深入研究VMA21基因突变如何通过影响V-ATP酶功能导致溶酶体酸化和自噬激活的分子机制,并为开发针对该通路的靶向治疗提供实验依据和候选药物。

Eskelinen, Eeva-Liisa; Yang, Ying; Wang, Fangyang; Malek, Sami N.; Klionsky, Daniel J.; Boudagh, GabrielEskelinen, Eeva-Liisa; Yang, Ying; Wang, Fangyang; Malek, Sami N.; Klionsky, Daniel J.; Boudagh, Gabriel
Taylor & Francis Group
2024-02-29 更新
浏览 16
autophagyfollicular lymphomalysosomal dysfunctionsurvivalVMA21 mutations
Follicular Lymphoma-associated VMA21 Mutations Activating Autophagy Dependency Dataset

基本信息

大小
0.04 GB
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-02-29
版本
v1

资源简介

滤泡性淋巴瘤相关VMA21基因突变激活自噬依赖性数据集

【数据集背景】

本数据集源站标题为《Follicular lymphoma-associated mutations in the V-ATPase chaperone VMA21 activate autophagy creating a targetable dependency》。配套论文《Follicular lymphoma-associated mutations in the V-ATPase chaperone VMA21 activate autophagy creating a targetable dependency》发表于 Autophagy(2022),DOI:10.1080/15548627.2022.2050663。项目资助方:This work was supported by the National Institute of General Medical Sciences [GM131919]; Leukemia and Lymphoma Society TRP program grant [6598-20]; Magnus Ehrnrooth Foundation [06032021]; National Cancer Institutes Rogel Scholar Award [P30CA046592].。源站首次发布:2022-03-15。

【数据内容】

源站原始描述:The discovery of recurrent mutations in subunits and regulators of the vacuolar-type H+-translocating ATPase (V-ATPase) in follicular lymphoma (FL) highlights a role for macroautophagy/autophagy, amino-acid, and nutrient-sensing pathways in the pathogenesis of this disease. Here, we report on novel mutations in the ER-resident chaperone VMA21, which is involved in V-ATPase assembly in 12% of FL. Mutations in a novel VMA21 hotspot (p.93X) result in the removal of a C-terminal non-canonical ER ret…

【数据结构与技术规格】

文件数 10 个,合计 39.43 MB。FL VMA21 supplement.pdf:application/pdf,3.00 MB。Supplementary Table 1 MALEK_MS1219_MSB-8778 8-19-20.xlsx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet,664.17 KB。Supplementary Table 2 MALEK_MS1226_MSB8874 10-12-20.xlsx:application/vnd.openxmlformats-officedocument.spreadsheetml.sheet,391.51 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.19360994.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Pharmacology、Infectious Diseases。主题标签:autophagy、follicular lymphoma、lysosomal dysfunction、survival、VMA21 mutations。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biochemistry、Medicine、Cell Biology、Genetics、Pharmacology、Infectious Diseases。

【获取与许可】

源站页面:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Follicular_lymphoma-associated_mutations_in_the_V-ATPase_chaperone_VMA21_activate_autophagy_creating_a_targetable_dependency/19360994

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Follicular lymphoma-associated mutations in the V-ATPase chaperone VMA21 activate autophagy creating a targetable dependency. Taylor & Francis. Wang, Fangyang; Yang, Ying; Boudagh, Gabriel; Eskelinen, Eeva-Liisa; Klionsky, Daniel J.; Malek, Sami N

【使用注意】

· 源站最后修改于 2024-02-29,引用时请注意版本时效。

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源站:https://tandf.figshare.com/articles/dataset/Follicular_lymphoma-associated_mutations_in_the_V-ATPase_chaperone_VMA21_activate_autophagy_creating_a_targetable_dependency/19360994/1

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数据说明

该数据集来源于一项关于滤泡性淋巴瘤(FL)分子病理机制的研究,重点关注V-ATP酶分子伴侣VMA21基因突变如何导致自噬激活并产生治疗依赖性。数据集包含来自滤泡性淋巴瘤患者的基因突变数据(特别是VMA21 p.93X热点突变)、细胞自噬活性测量结果(通过多种互补检测方法在人类和酵母细胞中验证)、溶酶体代谢组学数据(显示蛋白质降解功能受损)以及药物筛选数据(通过高通量显微镜筛选自噬抑制剂,发现多种临床级细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂具有潜在疗效)。数据通过实验研究构建,包括免疫沉淀、溶酶体分离、荧光蛋白标记等技术。该数据集主要用于研究滤泡性淋巴瘤的发病机制、自噬通路的调控机制以及开发针对V-ATP酶异常肿瘤的靶向治疗策略。

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