LinkedOmics葡萄膜黑色素瘤数据集
LinkedOmics整理的TCGA-UVM多组学数据,可用于葡萄膜黑色素瘤基因表达、临床关联和预后分析。包含多种数据模态,包含80条数据记录,适用于分类任务,专注于肿瘤领域的眼黑色素瘤研究。

基本信息
资源简介
LinkedOmics葡萄膜黑色素瘤数据集
【一句话概览】
LinkedOmics 数据下载门户提供葡萄膜黑色素瘤(TCGA-UVM)数据集,用于在 32 种癌症类型内部及之间分析多组学数据。该数据集受试者数为 80,涵盖临床、甲基化、miRNA、突变、RNAseq 和 SCNV 等数据类型,标签包括 Uveal Melanoma、TCGA-UVM、multi-omics、Clinical、Methylation、miRNA、Mutation、RNAseq、SCNV(来源 linkedomics.org)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Datasets for Uveal Melanoma (TCGA-UVM)》。
【数据内容】
源站原始描述:LinkedOmics :: Data Download LinkedOmics Analyzing multi-omics data within and across 32 cancer types Data Download Portal <- Explore LinkedOmics Datasets Cohort Overview Datasets for Uveal Melanoma (TCGA-UVM)
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):LinkedOmics :: 数据下载 LinkedOmics 分析32种癌症类型内部及跨类型多组学数据 数据下载门户 <- 探索LinkedOmics数据集 队列概览 葡萄膜黑色素瘤数据集(TCGA-UVM)
【主题与分类】
主题标签:Uveal Melanoma、TCGA-UVM、multi-omics、Clinical、Methylation、miRNA、Mutation、RNAseq、SCNV。
【适用方向】
多模态数据适合跨模态对齐、融合建模与联合表征学习方向的研究。
【获取与许可】
源站页面:https://www.linkedomics.org/data_download/TCGA-UVM/
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://www.linkedomics.org/data_download/TCGA-UVM/
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
LinkedOmics整理的TCGA-UVM多组学数据,可用于葡萄膜黑色素瘤基因表达、临床关联和预后分析。
数据加载示例(表格/文本类)
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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