C11orf95-RELA融合驱动室管膜瘤形成的独特表观遗传调控相关基因表达数据
该数据集包含室管膜瘤研究中C11orf95-RELA融合基因相关的多模态分子数据,具体包括基因结合位点(RELAFUS1-HA结合峰)、表观遗传标记(H3K27ac修饰峰)和调控元件(超级增强子)的列表,以及单细胞转录组特征基因与靶基因的重叠分析。这些数据主要应用于解析室管膜瘤形成过程中融合基因驱动的表观遗传调控机制,为理解肿瘤发生、寻找潜在治疗靶点提供重要的分子病理学资源。
https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_10_of_C11orf95-RELA_fusion_drives_aberrant_gene_expression_through_the_unique_epigenetic_regulation_for_ependymoma_formation/14183612
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资源简介
该数据集是研究C11orf95-RELA融合如何通过独特表观遗传调控机制驱动室管膜瘤形成的补充数据文件。数据集包含多个子表,具体包括:RELAFUS1-HA在H1203-mEPN细胞转录起始位点±10kb区域的结合峰(649个峰,对应520个基因);H41和H1203-mEPN细胞中的H3K27ac组蛋白修饰峰;两种mEPN细胞中鉴定出的超级增强子(SEs)列表;H41和H1203细胞超级增强子的重叠区域;以及单细胞转录组特征基因与RELAFUS1靶基因在293T-RELAFUS1或小鼠室管膜瘤细胞中的重叠基因列表。数据来源于室管膜瘤细胞系的表观基因组学和转录组学实验,主要应用于室管膜瘤的分子病理机制研究、融合基因功能分析以及表观遗传调控网络解析。
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