国际癌症基因组联盟 (ICGC)
国际癌症基因组联盟（ICGC）数据集是一个包含全球多种癌症类型的多组学数据（如基因组、转录组、表观基因组等）和临床信息的综合性资源，数据模态涵盖基因序列、表达谱、表观遗传标记及临床表格。该数据集主要用于癌症基因组学研究，支持癌症驱动基因识别、生物标志物开发、精准医疗策略探索以及泛癌分析等方向，旨在通过国际合作推动癌症诊断与治疗的创新。
基本信息
资源简介
国际癌症基因组联盟（ICGC）是一个专注于癌症基因组学研究的国际合作项目，旨在通过多组学方法（如基因组、转录组、表观基因组等）解析癌症的遗传基础，推动癌症诊断与治疗的突破。该数据集包含来自全球多种癌症类型的多组学测序数据、临床信息及相关元数据，数据来源于国际研究机构的合作贡献。ICGC数据门户网站已于2024年6月正式关闭，但其最新发布的数据和泛癌分析工作组（PCAWG）数据仍对授权用户开放。ICGC的新阶段项目——加速基因组肿瘤学研究（ICGC ARGO）正在推进，致力于将基因组学知识转化为改善癌症患者预后的方法。该数据集主要应用于癌症基因组学、生物标志物发现、精准医疗及癌症机制研究等领域。
下载信息
注册下载
Tips: 该数据集需要在对应的数据源网站注册通过后，才能进行数据下载，注册有对应要求，或者需要收费。
暂未开放公开下载
Tips: 该数据集属于公开下载，应该可以免费公开下载。
暂未开放有偿下载
Tips: 该数据集 Qianfanghub 可以协助提供有偿下载服务，注意，服务不针对数据相关产权，只是技术服务费。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放千方医数集，医疗数据集部分，是为社区服务的公开医疗数据集搜索引擎，并不存储或者下载原始的任何数据。 如果您有其他医疗数据需求，可以和客服联系，或者下工单。我们有强大的三甲医疗机构帮助您提供个性化的医疗数据定制、采集、标注服务。
使用方式
数据集获取
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
国际癌症基因组联盟（ICGC）是一个专注于癌症基因组学研究的国际合作项目，旨在通过多组学方法（如基因组、转录组、表观基因组等）解析癌症的遗传基础，推动癌症诊断与治疗的突破。该数据集包含来自全球多种癌症类型的多组学测序数据、临床信息及相关元数据，数据来源于国际研究机构的合作贡献。ICGC数据门户网站已于2024年6月正式关闭，但其最新发布的数据和泛癌分析工作组（PCAWG）数据仍对授权用户开放。ICGC的新阶段项目——加速基因组肿瘤学研究（ICGC ARGO）正在推进，致力于将基因组学知识转化为改善癌症患者预后的方法。该数据集主要应用于癌症基因组学、生物标志物发现、精准医疗及癌症机制研究等领域。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
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