MSK肉瘤数据集
MSK-IMPACT产生的肉瘤样本靶向测序和临床数据,数据目录显示包含14例隆突性皮肤纤维肉瘤病例。由Memorial Sloan Kettering Cancer Center提供,来自Childhood Cancer Data Catalog,数据格式为表格,包含2138条数据记录,适用于分类任务。

基本信息
资源简介
MSK肉瘤数据集
【一句话概览】
该数据集标题为 Sarcoma MSK,通过 MSK-IMPACT 对 2,138 例肉瘤样本及匹配的正常样本进行靶向测序,受试者数为 2,290。所纳入的病例仅限于 40 岁以下人群。源站标签包括肉瘤、靶向测序、MSK-IMPACT、cBioPortal,以及儿童、青少年和青年(来源 datacatalog.ccdi.cancer.gov)。
【数据集背景】
本数据集源站标题为《Sarcoma MSK》。
【数据内容】
源站原始描述:Targeted sequencing of 2,138 sarcoma samples and matched normals via MSK-IMPACT. The cases here are only those under the age of 40 years old
中文译文(机器翻译,仅供快速理解,请以原文为准):通过MSK-IMPACT对2,138例肉瘤样本及匹配的正常样本进行靶向测序。此处的病例仅限于40岁以下的患者。
【主题与分类】
主题标签:Sarcoma、Targeted sequencing、MSK-IMPACT、cBioPortal、Pediatric、Adolescent and Young Adult。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面:https://datacatalog.ccdi.cancer.gov/dataset/cBioPortal-Sarcoma_MSK
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
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免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
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使用方式
数据集获取
源站:https://datacatalog.ccdi.cancer.gov/dataset/cBioPortal-Sarcoma_MSK
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
MSK-IMPACT产生的肉瘤样本靶向测序和临床数据,数据目录显示包含14例隆突性皮肤纤维肉瘤病例。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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