结肠炎相关结肠癌的空间分辨转录组与细胞图谱
该数据集提供了结肠炎相关结肠癌患者样本的空间转录组数据，包含Xenium平台生成的高分辨率基因表达与细胞定位信息，数据模态为空间转录组学与单细胞注释。它整合了患者分组、疾病状态及多层次细胞类型（如上皮、免疫、基质细胞），并包含计算的空间邻域特征，主要用于研究结肠癌的肿瘤微环境空间结构、细胞异质性、炎症与癌症的相互作用，为癌症机制探索和生物标志物发现提供关键数据支持。
创建时间2025-12-15
更新时间2025-12-15
资源简介
该数据集是一个空间转录组学数据集，来源于结肠炎相关结肠癌（CAC）患者样本，使用Xenium Prime和Xenium v1平台生成。数据以.h5ad文件格式提供，包含经过整合与处理的空间转录组数据，涵盖不同患者分组、疾病类型（CAC、UC、HC）以及多层次的细胞类型注释（如上皮细胞、淋巴样细胞、髓样细胞、基质细胞等细分子类）。数据集还计算了Novae细胞邻域等空间特征，可用于研究结肠癌的肿瘤微环境、细胞异质性、空间组织结构及其与炎症性肠病的关联，为癌症生物学、免疫学和空间组学研究提供重要资源。
提供机构：Zenodo
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