模式化慢性淋巴细胞白血病的染色质激活谱分析

该数据集整合了来自46例慢性淋巴细胞白血病患者和15例正常对照的ChIP-Seq(针对H3K27ac组蛋白修饰)与RNA-seq多组学数据,主要包含染色质激活信号矩阵、基因表达计数矩阵以及差异乙酰化区域分析结果,通过多模态分子数据(表观遗传与转录组)系统解析CLL的模式化亚群特征与染色质调控机制,用于研究白血病的表观遗传异质性、疾病亚型特异性及潜在治疗靶点。

CNAG-CRGCNAG-CRG
Zenodo
2022-11-24 更新
浏览 13
分类慢性淋巴细胞白血病表观遗传学染色质激活谱分析
Chromatin Activation Profiling of Stereotyped Chronic Lymphocytic Leukemias

基本信息

大小
0.05 GB
任务类型
分类
许可
cc-by-4.0
创建/更新时间
2022-11-24

资源简介

模式化慢性淋巴细胞白血病的染色质激活谱分析

【数据集背景】

本数据集源站标题为《CHROMATIN ACTIVATION PROFILING OF STEREOTYPED CHRONIC LYMPHOCYTIC LEUKEMIAS》。源站首次发布:2022-07-21。

【数据内容】

源站原始描述:We used chromatin-immunoprecipitation followed by sequencing (ChIP-Seq) with an antibody for the H3K27ac (a bona fide histone mark for regulatory element activation) in sorted CLL cells from 46 CLL, including 21 cases from stereotyped subsets #1, #2, #4, and #8, and 15 normal B cell subpopulations. To understand their functional impact, we integrated our data with 16 RNA-seq data. Files description: - H3K27ac_freq2_FDR_consensus_2022.txt count matrix from H3K27ac signals - H3K27ac_FDR_consensus_…

主表 signature_RESAMPLING_ss8VSucll_2022.txt 含 67 列、样本前 1186 行结构完整。

【数据结构与技术规格】

文件数 4 个,合计 51.38 MB。数据集 DOI:10.5281/zenodo.7353716。

【适用方向】

结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/records/7353716

使用许可:cc-by-4.0。

【使用注意】

· 源站最后修改于 2022-11-24,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Zenodo 公开直链)

源站:https://zenodo.org/record/6865837

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数据说明

该数据集通过染色质免疫沉淀测序技术(ChIP-Seq)和RNA测序技术,对慢性淋巴细胞白血病(CLL)的染色质激活状态进行系统分析。数据来自46例CLL患者(包括21例属于模式化亚群#1、#2、#4和#8的病例)和15例正常B细胞亚群的细胞样本,使用H3K27ac抗体(一种调控元件激活的标志性组蛋白修饰)进行ChIP-Seq,并结合16例RNA-seq数据以评估其功能影响。数据集包含H3K27ac信号原始计数矩阵、批次校正后的H3K27ac信号矩阵、批次校正后的RNA-seq计数矩阵,以及U-CLL与模式化亚群#8之间差异乙酰化区域的分析结果。该数据集主要用于研究CLL的染色质调控机制、表观遗传异质性,以及模式化亚群的特异性激活特征,为白血病发病机制和潜在治疗靶点提供分子层面的见解。

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