与差异甲基化区域相关的差异表达基因数据集
该数据集包含来自9例混合型肝细胞癌-胆管癌(HCC-CCA)患者的肿瘤样本,通过RNA-seq和RRBS技术提供了分离的HCC与CCA组分的基因表达(文本/数值型)和DNA甲基化(表观遗传数值)数据,主要用于研究这种罕见肝脏肿瘤的分子异质性、表观遗传调控机制(如差异甲基化区域与差异表达基因的关联)以及探索潜在的预后生物标志物和治疗靶点。
https://figshare.com/articles/dataset/DEGs_associated_with_DMRs_/29160191
如需原始数据获取支持或标注服务,请联系我们。
资源简介
该数据集聚焦于混合型肝细胞癌-胆管癌(HCC-CCA),这是一种罕见的肝脏肿瘤,同时具有肝细胞癌和胆管癌的组织学特征。数据集包含了来自9例混合型HCC-CCA患者的福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)肿瘤样本,通过显微切割技术分离出其中的HCC和CCA组分。利用简化代表性亚硫酸氢盐测序(RRBS)和RNA-seq技术,分别对分离的组分进行了DNA甲基化谱(7例HCC和7例CCA)和基因表达谱(7例HCC和8例CCA)分析。研究旨在识别混合型HCC-CCA中不同组分间差异的表观遗传调控和基因表达模式,共鉴定出57个差异表达基因(DEGs)和808个差异甲基化区域(DMRs)。这些数据主要应用于研究HCC-CCA的肿瘤生物学、表观遗传调控机制(如Wnt信号通路、电压门控通道相关基因的甲基化变化)以及潜在的预后和治疗靶点,为改善这种致命疾病的治疗分层和策略优化提供分子依据。
精度瓶颈?数据缺失?
当前公开数据无法满足您的算法精度?千方提供针对 胆管癌 的高质量、多模态真实临床数据定制解决方案。