刚果民主共和国HPV筛查优化：自采样、临床采样与分子检测比较的复现数据

数据集获取

源站：https://doi.org/10.7910/DVN/94BEUM

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数据集大小约 51.0 KB。

数据说明

目的。鉴于需要在刚果民主共和国（DRC）等资源匮乏地区扩大宫颈癌筛查的可及性，我们旨在评估自采阴道样本在检测高危型人乳头瘤病毒（hrHPV）方面的诊断性能。我们还试图比较两种分子检测方法——careHPV®和cobas®4800，并评估careHPV®采集介质与基于PCR平台的潜在兼容性。方法。在刚果民主共和国金沙萨参加宫颈癌筛查项目的482名25至65岁女性中开展了一项横断面研究。每位参与者提供了三份标本：一份自采阴道拭子、一份临床医生采集的宫颈拭子（两者均保存在careHPV®采集介质中），以及一份保存在ThinPrep®中的液基细胞学样本。使用careHPV®和/或cobas®4800对样本进行hrHPV检测。以液基细胞学上的cobas®4800结果作为参考，计算敏感性、特异性、预测值和一致性（Cohen’s kappa）。结果。

使用careHPV®检测法，自采样本的敏感性为54.9%，特异性为95.6%，而医生采集样本的敏感性为61.8%，特异性为95.0%，均与液基细胞学中的hrHPV检测相比较。采用cobas®4800检测时，自采样本的敏感性达到88.1%，特异性为89.5%，准确性为89.3%。医生采集样本的表现最佳，敏感性为96.1%，准确性为92.9%。不同检测方法之间的一致性显著，尤其是自采样本（κ = 0.798）。当cobas®4800用于检测保存在careHPV®培养基中的样本时，未观察到明显的性能下降。结论：在刚果民主共和国（DRC）背景下，自采样是hrHPV检测的一种可行替代方案，尤其当与基于PCR的检测方法结合使用时，可能有助于扩大服务不足地区的筛查覆盖率。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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