PRJNA188552：早期宫颈癌复发预测的基因表达谱分析
数据围绕早期宫颈癌的基因表达谱展开，可用于探索与复发相关的转录组特征，并构建复发预测模型。源站描述仅说明 BioProject 是汇集单一项目相关生物数据的记录，提供统一入口链接到该项目产生的多种数据类型，未提供样本量、测序平台、随访信息等具体细节（来源 NCBI）
基本信息
资源简介
PRJNA188552：早期宫颈癌复发预测的基因表达谱分析
PRJNA188552 是一个围绕早期宫颈癌复发预测而建立的基因表达谱数据集，英文全称为 Genetic profiling to predict recurrence of early cervical cancer。该数据集归属于肿瘤领域的宫颈癌方向，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明其核心数据属于转录组或基因表达层面。整体来看，该数据集旨在通过基因层面的表达信息，帮助研究者探索与早期宫颈癌复发相关的转录组特征，并在此基础上构建复发预测模型。数据来源为 NCBI 的 BioProject 数据库，源站标题为 Homo sapiens (ID 188552) - BioProject - NCBI，说明该项目对应的是人类样本。需要注意的是，源站描述仅对 BioProject 这一记录类型作了通用说明，并未提供样本量、测序平台、随访信息等具体细节，因此该数据集在具体实验设计和临床信息方面的公开描述较为有限。
【数据集背景】
该数据集以早期宫颈癌的复发预测为核心目标。宫颈癌是肿瘤研究中的重要方向之一，而早期宫颈癌患者在治疗后仍存在复发风险，因此识别与复发相关的分子特征具有研究价值。该数据集通过基因表达谱的方式，尝试从转录组层面刻画与复发相关的生物学差异，从而为预测模型的建立提供数据基础。其英文名称明确指向“Genetic profiling to predict recurrence of early cervical cancer”，说明项目设计初衷即服务于复发预测这一应用场景。源站将其归类于 Homo sapiens，表明研究对象为人类。整体背景上，该项目属于肿瘤转录组研究范畴，主题标签为 Transcriptome or Gene expression，进一步确认了其数据类型的表达谱属性。
【数据内容】
该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，说明其内容主要涉及转录组或基因表达数据。结合数据集名称可知，这些表达数据用于早期宫颈癌复发相关研究。BioProject 记录本身是汇集单一项目相关生物数据的集合，提供统一入口以链接到该项目产生的多种数据类型。因此，该数据集可能包含由该项目衍生的表达谱相关数据记录，但源站描述未具体列出所包含的文件类型、数据格式或数据规模。关于样本量、测序平台、随访信息等具体细节，源站未提供。除主题标签和项目名称所反映的表达谱属性外，数据内容的具体构成在现有信息中未作进一步说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI 的 BioProject 数据库，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 Homo sapiens (ID 188552) - BioProject - NCBI。BioProject 是由单一组织或联盟发起的、与某一项计划相关的生物数据集合，其记录为用户提供统一入口，以便找到该项目产生的多种数据类型。该数据集的英文名称为 PRJNA188552: Genetic profiling to predict recurrence of early cervical cancer，表明其在 BioProject 中的项目编号为 PRJNA188552。关于样本采集方式、采集地点、采集时间、伦理审批信息以及具体实验流程，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于围绕早期宫颈癌复发相关的转录组研究。具体而言，可用于探索与复发相关的基因表达特征，并在此基础上构建或验证复发预测模型。由于其主题标签为 Transcriptome or Gene expression，适合用于基因表达层面的分析，例如差异表达分析、表达谱特征筛选等通用转录组研究用途。此外，该数据集也可作为肿瘤生物信息学研究中关于宫颈癌复发方向的参考数据资源。但需注意，源站未提供样本量、测序平台和随访信息等细节，因此在需要明确临床终点或实验条件的研究中，使用前应结合项目原始记录进一步确认。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 数据库访问，项目编号为 PRJNA188552。BioProject 记录提供统一入口，用户可由此找到该项目产生的多种数据类型。具体的数据下载方式、文件组织结构和分析流程，源站未提供。由于源站描述仅说明 BioProject 是汇集单一项目相关生物数据的记录，并未给出该项目的样本信息、平台信息或随访信息，因此在实际使用中，研究者需要依据项目记录中的链接进一步获取相关数据。关于数据处理、标准化或分析步骤，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集的主要限制在于公开描述信息较为有限。源站描述仅对 BioProject 的通用性质作了说明，未提供样本量、测序平台、随访信息等具体细节。这意味着在缺乏这些关键信息的情况下，难以对数据集的规模、技术特征和临床背景作出完整评估。此外，源站未提供关于数据质量控制、缺失值处理或批次效应等方面的说明。因此，在使用该数据集时，应注意到其具体实验设计和数据质量信息在现有来源中并未充分披露。该数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，其表达谱属性明确，但围绕复发预测所需的临床随访信息是否完整，源站未提供。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为 Homo sapiens (ID 188552) - BioProject - NCBI，项目英文名称为 PRJNA188552: Genetic profiling to predict recurrence of early cervical cancer。关于该数据集的引用方式、许可条款或使用限制，源站未提供。用户在使用时应参考 NCBI BioProject 数据库的相关规定以及项目原始记录中的说明。由于源站未提供具体的引用格式和许可信息，建议在正式使用前查阅项目页面以获取最新和准确的引用与授权要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA188552
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
我们比较了在单一大规模人群中建立的基因集预后模型与临床预后模型对疾病复发的预测能力，以探讨遗传定量方法在接受根治性子宫切除术并伴或不伴辅助治疗的早期宫颈癌患者中是否具有显著的预后作用。用于预测早期宫颈癌无病生存的基因集模型，是利用来自韩国首尔成均馆大学医学院三星医疗中心2002年1月至2008年9月期间接受根治性手术伴或不伴辅助治疗的早期宫颈癌患者队列的DASL检测数据集建立的。临床预测模型也在同一队列中建立，并比较了各模型预测复发的能力。总体设计：在300例患者中获得了合格的DASL检测图谱，我们为基因集模型选择了12个基因。
当根据LOOCV程序使用这些基因的预后评分将患者比例分为低风险或高风险时，Kaplan-Meier曲线显示两组之间的复发率存在显著差异。临床模型是基于FIGO分期以及术后病理结果开发的。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
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