HIV-1感染免疫细胞旁分泌信号重编程宫颈癌通路

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD077909

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

人乳头瘤病毒（HPV）与1型人类免疫缺陷病毒（HIV-1）共感染的女性，其罹患宫颈癌的风险是未感染HIV女性的六倍。为评估HIV感染的T细胞旁分泌信号如何重塑培养中宫颈上皮细胞的蛋白质组，研究人员从两名健康供者的外周血单个核细胞富集白细胞单采产物（leukopaks）中分离出原代CD4+ T细胞，将其感染或未感染具有复制能力的pNL4-3 HIV-1毒株，培养72小时。随后，用CD4+ T细胞培养物的分泌组刺激人HPV阴性宫颈上皮细胞系C33A 72小时。之后收集C33A细胞，裂解细胞，消化细胞裂解物，并进行基于全局定量质谱（MS）的丰度蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学分析。蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学结果均采用生物信息学方法进行分析。这些数据集揭示了MAPK、PI3K-AKT和β-catenin信号通路中蛋白质表达的改变。此外，MS磷酸化蛋白质组学分析证实，暴露于HIV-1感染T细胞条件培养基的宫颈细胞中PI3K-AKT通路被激活。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。