IDC TCGA-CESC 宫颈癌影像数据集
IDC TCGA-CESC 是来自影像数据共享平台 IDC 的 TCGA 宫颈癌影像集合,涵盖宫颈鳞状细胞癌与宫颈腺癌两种癌症类型,肿瘤部位为宫颈,共 307 名受试者

基本信息
资源简介
IDC TCGA-CESC 宫颈癌影像数据集
IDC TCGA-CESC 是来自影像数据共享平台 IDC 的 TCGA 宫颈癌影像集合,涵盖宫颈鳞状细胞癌与宫颈腺癌两种癌症类型,肿瘤部位为宫颈,共 307 名受试者。该集合是 TCGA 数据增强工作的一部分,由癌症影像计划(CIP)与多家 TCGA 组织贡献机构合作,对经基因分析的 CESC 病例的放射影像进行归档,并包含经 DICOM 转换的 Slide Microscopy 图像。该数据可用于宫颈癌的影像研究、放射影像与基因组数据关联分析,以及相关算法开发与验证(来源 portal.imaging.datacommons.cancer.gov)。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):IDC collection TCGA-CESC。癌症类型:宫颈鳞状细胞癌、宫颈腺癌。肿瘤部位:宫颈。受试者:307。The Cancer Genome Atlas-宫颈鳞状细胞癌与宫颈腺癌(TCGA-CESC)数据集合是一项更大工作的一部分,旨在用经过特征描述的放射影像增强 TCGA 数据集。癌症影像计划(CIP)与多家 TCGA 组织贡献机构合作,正在努力归档经基因分析的 CESC 病例的很大一部分放射影像。请查看 TCGA-CESC( TCGA-CESC 集合的 DICOM 转换 Slide Microscopy 图像(
【主题与分类】
主题标签:Cervix。本站分类:肿瘤/宫颈癌。
【获取与许可】
源站页面:https://portal.imaging.datacommons.cancer.gov/explore/filters?collection_id=tcga_cesc
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://portal.imaging.datacommons.cancer.gov/explore/filters?collection_id=tcga_cesc
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
IDC 数据集 TCGA-CESC。癌症类型:宫颈鳞状细胞癌、宫颈内膜腺癌。肿瘤位置:宫颈。受试者:307 例。癌症基因组图谱-宫颈鳞状细胞癌和宫颈内膜腺癌(TCGA-CESC)数据收集是旨在通过特征化放射影像增强 TCGA http://cancergenome.nih.gov/ 数据集的更大努力的一部分。癌症影像计划(CIP)与几个 TCGA 组织贡献机构合作,正在努力归档经基因分析的 CESC 病例的大部分放射影像。请参阅 TCGA-CESC(https://doi.org/10.7937/K9/TCIA.2016.SQ4M8YP4)页面,以了解有关放射影像的更多信息并获取此集合的任何支持性元数据。请参阅 TCGA-CESC 集合的 DICOM 转换的切片显微图像(https://doi.org/10.5281/zenodo.12689956)页面,以了解有关组织病理学图像的更多信息并获取此集合的任何支持性元数据。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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