空间组织的发育细胞状态关联副神经节瘤数据集

该数据集来自 figshare,包含小鼠胚胎期与出生后及肿瘤相关样本的 processed 单细胞 RNA-seq 数据,以及野生型、Kif1bβ KO 和肿瘤样本的小鼠原位测序数据,另含人源 snRNA 与 VisiumHD 样本文件,共 16 个文件

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2026-09-02 更新
浏览 11
基因组分类NeuroblastomaParaganglioma, PheochromocytomaDevelopmental cell statesHybrid cell states
Spatially organized developmental cell states link paraganglioma and

基本信息

模态
基因组
大小
10.337080808 GB
任务类型
分类
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2026-09-02
版本
v4

资源简介

空间组织的发育细胞状态关联副神经节瘤数据集

Spatially organized developmental cell states link paraganglioma and

该数据集来自 figshare,包含小鼠胚胎期与出生后及肿瘤相关样本的 processed 单细胞 RNA-seq 数据,以及野生型、Kif1bβ KO 和肿瘤样本的小鼠原位测序数据,另含人源 snRNA 与 VisiumHD 样本文件,共 16 个文件。数据覆盖小鼠交感肾上腺组织发育、肾上腺 gland 与副神经节瘤/嗜铬细胞瘤相关样本,可用于研究发育细胞状态与 hybrid 细胞状态在肿瘤发生中的空间组织特征(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

源站首次发布:2026-09-02。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):小鼠数据集 文件说明 对应图 SchlisioLab_E17_Mouse.h5ad 来自胚胎第17天(E17)小鼠交感肾上腺组织的处理后单细胞 RNA-seq 数据 图4;补充图6 SchlisioLab_Postnatal_Mouse.h5ad 来自出生后及肿瘤相关小鼠样本的处理后单细胞 RNA-seq 数据 图6;补充图9 Sample_A2_final_gobject_Merged_ReScaled.rds 来自野生型(WT)肾上腺 gland 样本A2的处理后小鼠原位测序数据 补充图10 Sample_B2_final_gobject_Merged_ReScaled.rds 来自无肿瘤的Kif1bβ KO肾上腺 gland 样本B2的处理后小鼠原位测序数据 补充图10 Sample_B4_final_gobject_Merged_ReScaled.rds 来自肿瘤样本B4(无诊断)的处理后小鼠原位测序数据 补充图10 Sample_B1_final_gobject_Merged_ReScaled.rds 来自

【数据结构与技术规格】

文件数 16 个,合计 10.34 GB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.33408337.v4。

【主题与分类】

源站学科分类:Genomics and transcriptomics。主题标签:Neuroblastoma、Paraganglioma, Pheochromocytoma、Developmental cell states、Hybrid cell states。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Genomics and transcriptomics。

【获取与许可】

源站页面:https://figshare.com/articles/dataset/_b_Sympathoadrenal_Development_and_Tumorigenesis_Processed_Transcriptomic_Data_b_/33408337

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Schlisio, Susanne (2026). Spatially organized developmental cell states link paraganglioma and. figshare. Dataset

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "SchlisioLab_E17_Mouse.h5ad" "https://ndownloader.figshare.com/files/68112436"
curl -L -o "SchlisioLab_Postnatal_Mouse.h5ad" "https://ndownloader.figshare.com/files/68112439"
curl -L -o "SchlisioLab_Human_snRNA_Normal_AG.rds" "https://ndownloader.figshare.com/files/68118253"
curl -L -o "SchlisioLab_Human_snRNA_PPGL_NB.rds" "https://ndownloader.figshare.com/files/68118256"
curl -L -o "SchlisioLab_Human_VisiumHD_PPGL_1.rds" "https://ndownloader.figshare.com/files/68118283"
curl -L -o "SchlisioLab_Human_VisiumHD_PPGL_2.rds" "https://ndownloader.figshare.com/files/68118274"
curl -L -o "Sample_A2_final_gobject_Merged_ReScaled.rds" "https://ndownloader.figshare.com/files/68137186"
curl -L -o "Sample_A4_final_gobject_Merged_ReScaled.rds" "https://ndownloader.figshare.com/files/68137204"

文件清单

  • SchlisioLab_E17_Mouse.h5ad(104.11 MB)
  • SchlisioLab_Postnatal_Mouse.h5ad(129.37 MB)
  • SchlisioLab_Human_snRNA_Normal_AG.rds(75.75 MB)
  • SchlisioLab_Human_snRNA_PPGL_NB.rds(289.77 MB)
  • SchlisioLab_Human_VisiumHD_PPGL_1.rds(5.81 GB)
  • SchlisioLab_Human_VisiumHD_PPGL_2.rds(3.86 GB)
  • Sample_A2_final_gobject_Merged_ReScaled.rds(2.72 MB)
  • Sample_A4_final_gobject_Merged_ReScaled.rds(12.13 MB)
  • Sample_A5_final_gobject_Merged_ReScaled.rds(12.62 MB)
  • Sample_A6_final_gobject_Merged_ReScaled.rds(4.37 MB)
  • Sample_B1_final_gobject_Merged_ReScaled.rds(11.67 MB)
  • Sample_B2_final_gobject_Merged_ReScaled.rds(3.74 MB)
  • Sample_B4_final_gobject_Merged_ReScaled.rds(2.42 MB)
  • Sample_B6_final_gobject_Merged_ReScaled.rds(4.60 MB)
  • Sample_B7_final_gobject_Merged_ReScaled.rds(14.76 MB)
  • SchlisioLab_BulkRNA_Deconvolution.csv(33.64 KB)

文件总体积 10.34 GB(源站 API 实测)。

数据说明

小鼠数据集
文件
描述
对应图片
SchlisioLab_E17_Mouse.h5ad 胚胎第17天(E17)小鼠交感肾上腺组织的处理后单细胞RNA测序数据
图4;补充图6
SchlisioLab_Postnatal_Mouse.h5ad 出生后及肿瘤相关小鼠样本的处理后单细胞RNA测序数据
图6;补充图9
Sample_A2_final_gobject_Merged_ReScaled.rds 野生型(WT)肾上腺样本A2的处理后小鼠原位测序数据
补充图10
Sample_B2_final_gobject_Merged_ReScaled.rds 无肿瘤的Kif1bβ基因敲除(KO)肾上腺样本B2的处理后小鼠原位测序数据
补充图10
Sample_B4_final_gobject_Merged_ReScaled.rds 肿瘤样本B4(未诊断)的处理后小鼠原位测序数据
补充图10
Sample_B1_final_gobject_Merged_ReScaled.rds 肿瘤样本B1(诊断为嗜铬细胞瘤)的处理后小鼠原位测序数据
补充图10
Sample_A6_final_gobject_Merged_ReScaled.rds 肿瘤样本A6(未诊断)的处理后小鼠原位测序数据
补充图10
Sample_B7_final_gobject_Merged_ReScaled.rds 肿瘤样本的处理后小鼠原位测序数据

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.33408337.v4(source: https://figshare.com/articles/dataset/_b_Sympathoadrenal_Development_and_Tumorigenesis_Processed_Transcriptomic_Data_b_/33408337)。

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