小鼠胶质母细胞瘤亚型单细胞图谱
该数据集来自 CZ CELLxGENE，收录了免疫健全小鼠胶质母细胞瘤模型的单细胞 RNA 测序数据，涵盖 EGFR、NF1 驱动的 GBM 各三个样本以及 PDGFB 驱动的 GBM 四个样本，总计超过 94,000 个细胞，组织来源为脑，检测平台为 10x 3' v3
基本信息
资源简介
小鼠胶质母细胞瘤亚型单细胞图谱
该数据集来自 CZ CELLxGENE，收录了免疫健全小鼠胶质母细胞瘤模型的单细胞 RNA 测序数据，涵盖 EGFR、NF1 驱动的 GBM 各三个样本以及 PDGFB 驱动的 GBM 四个样本，总计超过 94,000 个细胞，组织来源为脑，检测平台为 10x 3' v3。数据可用于刻画 GBM 基因型与免疫表型之间的关系，支持对 classical、mesenchymal、proneural 三种亚型及其肿瘤微环境特征的分析，适用于细胞类型注释、亚型分类及相关比较研究（来源 cellxgene.cziscience.com）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：GBM 通常被分为三种亚型——classical、mesenchymal 和 proneural——分别由 EGFR、NF1 和 PDGFRA 的特定基因突变驱动。然而，这些驱动突变对 GBM 肿瘤微环境（TME）的影响尚未被完全理解。在本研究中，我们分析了来自免疫健全小鼠模型的单细胞 RNA 测序的超过 94,000 个细胞，其中包括 EGFR 和 NF1 驱动的 GBM 各三个样本以及 PDGFB 驱动的 GBM 四个样本，以系统性地刻画 GBM 中基因型与免疫表型之间的关系。疾病：glioblastoma。组织：brain。检测方法：10x 3' v3。单细胞数据集（CZ CELLxGENE）。
【主题与分类】
主题标签：glioblastoma。本站分类：肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://cellxgene.cziscience.com/collections/6d7d23d0-237d-4430-9200-92858abba2d8
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pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
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- OpenDataLab:
数据说明
GBM通常分为三种亚型——经典型、间充质型和前神经型——分别由EGFR、NF1和PDGFRA的特定基因突变驱动。然而，这些驱动突变对GBM肿瘤微环境（TME）的影响尚未完全明了。在本研究中，我们分析了来自免疫活性小鼠模型单细胞RNA测序的超过94,000个细胞，其中包括EGFR和NF1驱动的GBM各三个样本，以及PDGFB驱动的GBM四个样本，以系统性地刻画GBM中基因型与免疫表型之间的关系。疾病：胶质母细胞瘤。组织：脑。检测方法：10x 3’ v3。单细胞数据集（CZ CELLxGENE）。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连，提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
