PRJNA921878：预测pLGG中MAPKi敏感性的MAPK相关基因特征 - Charite队列
数据围绕MAPK相关基因特征，用于预测pLGG（儿童低级别胶质瘤）对MAPK抑制剂（MAPKi）的敏感性，来源于Charite队列
基本信息
资源简介
PRJNA921878：预测pLGG中MAPKi敏感性的MAPK相关基因特征 - Charite队列
该数据集英文名为“PRJNA921878: MAPK-related gene signature predicting MAPKi sensitivity in pLGG - Charite cohort”，来源于NCBI BioProject数据库，源站标题为“MAPK-related gene signature predicting MAPKi sensi... (ID 921878) - BioProject - NCBI”。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，本站分类归入肿瘤 / 脑肿瘤。数据围绕MAPK相关基因特征，用于预测pLGG（儿童低级别胶质瘤）对MAPK抑制剂（MAPKi）的敏感性，来源于Charite队列。该数据集属于BioProject体系下的生物学数据集合，旨在为研究者提供与特定研究计划相关的多种数据类型链接入口，便于集中发现和访问该项目产生的转录组或基因表达数据。
【数据集背景】
该数据集属于BioProject体系。BioProject是围绕单一研究计划、由单一组织或联盟发起的一组生物学数据的集合。BioProject记录为用户提供一个统一入口，用于查找该项目所产生的多种数据类型。本数据集聚焦于MAPK相关基因特征，旨在预测pLGG（儿童低级别胶质瘤）对MAPK抑制剂（MAPKi）的敏感性，研究队列来自Charite。本站将其归类为肿瘤 / 脑肿瘤，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据核心属于转录组或基因表达范畴。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其内容涉及转录组或基因表达数据。数据围绕MAPK相关基因特征展开，用于预测pLGG对MAPK抑制剂（MAPKi）的敏感性。数据集英文名中包含“MAPK-related gene signature predicting MAPKi sensitivity in pLGG - Charite cohort”，进一步表明其内容与MAPK相关基因特征、MAPKi敏感性预测以及Charite队列相关。关于具体的样本数量、基因数量、表达矩阵、临床信息字段等详细数据内容，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于NCBI BioProject数据库，来源站为ncbi.nlm.nih.gov。其英文名中标注了“Charite cohort”，表明数据队列来自Charite。BioProject记录本身提供用户查找该项目所产生多种数据类型的统一入口，这些数据可能来自单一组织或联盟。关于具体的采集时间、采集地点、样本收集流程、伦理审批信息、测序平台或实验方法等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与pLGG（儿童低级别胶质瘤）相关的MAPK抑制剂敏感性预测研究，尤其是基于MAPK相关基因特征的转录组或基因表达分析。其主题标签“Transcriptome or Gene expression”表明可用于基因表达层面的探索。本站分类为肿瘤 / 脑肿瘤，提示其可服务于脑肿瘤领域的相关研究。关于更具体的适用场景，如特定分析流程、临床转化应用或药物开发阶段等，源站未提供。
【使用方法】
该数据集以BioProject记录形式提供，用户可通过BioProject记录查找与该项目相关的多种数据类型链接。关于具体的数据下载方式、文件格式、分析工具、预处理步骤或代码示例等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于NCBI BioProject，属于公开数据库记录。关于数据质量指标、批次效应、样本量、缺失值情况、技术偏差或验证程度等，源站未提供。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，但具体数据质量与限制需结合源站进一步信息判断，当前源站未提供相关内容。
【引用与许可】
关于该数据集的引用方式、许可协议、使用条款或版权信息等，源站未提供。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA921878
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
MAPK抑制剂敏感性评分（MSS）旨在预测儿童低级别胶质瘤（pLGG）对MAPK抑制剂的敏感性。这些评分已在pLGG细胞系体外实验及公开可获取的儿童脑肿瘤图谱数据集中得到验证。在独立数据集中的验证是必要的。总体设计：对接受MAPK抑制剂治疗前的原发性pLGG样本进行基因表达谱分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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