PRJNA765593:配对正常与胶质母细胞瘤患者小样本组织的下一代测序
该数据集来自 NCBI BioProject(ID 765593),主题为配对正常组织与胶质母细胞瘤患者小样本组织的下一代测序,主题标签为 Transcriptome or Gene expression,本站归类为肿瘤 / 脑肿瘤

基本信息
资源简介
PRJNA765593:配对正常与胶质母细胞瘤患者小样本组织的下一代测序
PRJNA765593 是 NCBI BioProject 数据库中收录的一项下一代测序项目,其完整英文名称为“Next Generation Sequencing from small sizes of paired normal and glioblastoma patient tissues”。该项目聚焦于胶质母细胞瘤患者体内配对正常组织与肿瘤组织的小样本测序研究,主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,在本站被归类为肿瘤 / 脑肿瘤方向。BioProject 作为生物数据集合,旨在将同一研究计划下产生的多种数据类型汇聚于单一记录中,便于用户集中查找和访问。该项目正是通过这一框架,为胶质母细胞瘤相关转录组或基因表达研究提供数据入口,适合关注脑肿瘤分子特征的研究人员参考使用。
【数据集背景】
胶质母细胞瘤是脑肿瘤研究中的重要对象,针对其开展分子层面的测序分析有助于理解肿瘤发生发展中的基因表达变化。该数据集来自 NCBI BioProject,项目编号为 765593,其标题明确指向“配对正常与胶质母细胞瘤患者组织”的小样本下一代测序。所谓“配对”,通常意味着同一患者来源的正常组织与肿瘤组织被成对采集和比较,这种设计在肿瘤转录组研究中具有减少个体间差异干扰的潜在价值。BioProject 作为一项由单一机构或联盟发起的生物数据集合,为该项目提供了统一的记录入口,使用户能够从同一位置链接到项目所产生的多种数据类型。该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,说明其数据内容与转录组或基因表达相关,而非基因组、表观组等其他类型。本站将其归入肿瘤 / 脑肿瘤分类,进一步明确了其在疾病研究中的位置。
【数据内容】
该数据集的核心内容是针对小尺寸配对正常组织和胶质母细胞瘤患者组织所开展的下一代测序数据。项目主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明所生成的数据主要服务于转录组或基因表达层面的分析。由于项目名称中强调“small sizes”,可以理解为其关注的是小样本组织条件下的测序,但具体样本数量、测序平台、读长、覆盖度等细节,源站未提供。BioProject 记录本身并不直接展示所有原始数据,而是提供指向该项目所产生各类数据的链接,用户可通过这些链接进一步获取测序数据及相关信息。数据的具体组织形式、文件格式和存储位置,源站未提供。
【采集与来源】
该项目的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,即美国国家生物技术信息中心(NCBI)的 BioProject 数据库。项目编号为 765593,英文标题为“Next Generation Sequencing from small sizes of paired normal and glioblastoma patient tissues”。从标题可知,样本涉及胶质母细胞瘤患者,并包含配对正常组织与肿瘤组织,且强调组织样本尺寸较小。关于样本采集的具体地点、时间、伦理审批信息、患者人口学特征以及样本处理流程,源站未提供。BioProject 记录通常由单一组织或联盟提交,但该项目的具体提交机构、合作方及资助信息,源站未提供。
【适用场景】
基于其主题标签和分类,该数据集适用于转录组或基因表达相关的研究场景,尤其是围绕胶质母细胞瘤与配对正常组织比较的分析。研究人员可能利用此类数据探索肿瘤与正常组织之间的基因表达差异、可变剪接、融合基因或非编码 RNA 表达等,但具体分析方向需依据实际数据内容确定。由于项目强调小样本组织测序,该数据也可能对微量样本处理及低起始量测序方法的研究具有参考意义。此外,该数据可服务于脑肿瘤分子机制研究、生物标志物发现以及转录组数据整合分析等场景。需要说明的是,以上适用方向基于主题标签和分类的通用理解,源站未针对该数据集列出具体的推荐应用场景。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 数据库,以项目编号 765593 或项目英文名称进行检索,访问该项目的记录页面。BioProject 记录提供指向该项目所产生各类数据的链接,用户可据此定位到相关的测序数据、样本信息及可能的分析结果。具体的数据下载方式、访问权限、所需工具及分析流程,源站未提供。由于 BioProject 本身是数据集合的入口,实际使用中可能需要结合其他 NCBI 资源或项目关联数据库进行操作。建议用户在使用前仔细阅读项目页面上的说明及关联数据页面的指引。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject,属于公共生物数据资源,其记录遵循 BioProject 的一般规范。然而,关于该项目的具体质量控制指标、测序深度、数据完整性、样本量、重复数以及潜在偏差,源站未提供。项目名称中提及“small sizes”,可能意味着样本组织量较少,但这是否对数据质量构成限制,源站未提供说明。此外,该数据集是否经过同行评审、是否有相关发表文献支持,源站未提供。用户在使用时应自行评估数据适用性,并注意 BioProject 记录本身可能不包含完整的实验设计和分析细节。
【引用与许可】
该数据集的引用方式、许可协议、使用条款以及是否允许商业用途等信息,源站未提供。用户在使用该数据时,应参考 NCBI BioProject 的通用使用政策,并尽可能追溯项目关联的原始文献或数据提交者所指定的引用要求。由于源站未提供具体的许可声明,建议用户直接访问项目页面获取最新信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA765593
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
尽管胶质母细胞瘤(GBM)的多组学研究已增进了对其生物学本质的理解并加速了靶向治疗,但配对癌旁正常组织的数据仍然有限。在此,我们报告了使用Illumina Novaseq平台测序的胶质母细胞瘤(GBM)患者2对配对和1个非配对肿瘤及癌旁正常组织(NAT)的转录组,并生成了150 bp双端读长。该数据集为配对GBM与正常组织提供了资源,以识别新的肿瘤特异性癌基因或抑癌基因。总体设计:2对配对和1个非配对GBM组织及NAT的mRNA图谱
数据缺失?
依托陕西、四川两大基地,我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系,覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程,为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务?立即联系我们获取专业方案。




