PRJNA635573：髓母细胞瘤功能精准医学鉴定新治疗候选物（表达数据集）
该数据集来自 NCBI BioProject（编号 PRJNA635573），主题为通过功能精准医学鉴定髓母细胞瘤的新治疗候选物，属于表达数据集，主题标签为 Transcriptome or Gene expression
基本信息
资源简介
PRJNA635573：髓母细胞瘤功能精准医学鉴定新治疗候选物（表达数据集）
PRJNA635573 是一个来自 NCBI BioProject 数据库的表达数据集，其完整英文名称为“Functional precision medicine identifies new therapeutic candidates for medulloblastoma (expression dataset)”。该数据集围绕髓母细胞瘤这一脑肿瘤类型，以功能精准医学为研究思路，旨在鉴定新的治疗候选物。从主题标签来看，它属于转录组或基因表达范畴，因此其核心数据应为基因表达层面的信息。该数据集在 NCBI BioProject 中以编号 635573 登记，源站标题为“Functional precision medicine identifies new thera... (ID 635573) - BioProject - NCBI”，本站将其归类于肿瘤 / 脑肿瘤方向。整体而言，这是一个依托 BioProject 框架组织的表达数据集，服务于髓母细胞瘤治疗候选物发现这一研究目标。
【数据集背景】
该数据集对应的研究主题为“通过功能精准医学鉴定髓母细胞瘤的新治疗候选物”。髓母细胞瘤属于脑肿瘤的一种，而功能精准医学是一种以功能层面数据指导治疗策略筛选的研究范式。该数据集正是这一研究背景下的表达数据集，其主题标签明确指向转录组或基因表达。源站标题也直接体现了这一研究目标，即“Functional precision medicine identifies new therapeutic candidates for medulloblastoma”。该数据集所属的 BioProject 编号为 PRJNA635573，在 NCBI 平台上以 ID 635573 进行标识。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其内容属于转录组或基因表达数据。作为表达数据集，其数据应围绕基因表达水平展开，用于支撑功能精准医学框架下对髓母细胞瘤治疗候选物的鉴定。该数据集在 BioProject 中的记录提供了指向该项目所生成多种数据类型的链接入口。关于具体的样本数量、基因数量、表达矩阵维度、测序平台或具体表达值等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 NCBI BioProject，来源站为 ncbi.nlm.nih.gov。BioProject 是一个与单一研究计划相关的生物数据集合，该计划源自单一组织或联盟。BioProject 记录为用户提供一个统一入口，以便查找该项目所生成的不同数据类型。该数据集的 BioProject 编号为 PRJNA635573，源站标题为“Functional precision medicine identifies new thera... (ID 635573) - BioProject - NCBI”。关于具体的样本采集地点、采集时间、伦理审批信息或实验操作流程，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与髓母细胞瘤相关的基因表达分析场景，尤其是在功能精准医学研究框架下，用于探索或验证新的治疗候选物。由于主题标签为转录组或基因表达，其潜在应用包括表达谱层面的差异分析、候选治疗靶点的表达特征评估等。该数据集也可作为 BioProject 体系下的表达数据资源，供研究人员查找和链接同一项目下的其他数据类型。关于具体的适用疾病亚型、治疗药物类别或分析流程，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 平台访问，其标识为 PRJNA635573 或 ID 635573。BioProject 记录提供指向该项目所生成不同数据类型的链接，用户可据此定位表达数据集及相关资源。关于具体的数据下载格式、预处理步骤、标准化方法或分析工具，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于公开登记的研究项目资源。其主题标签为转录组或基因表达，数据内容围绕髓母细胞瘤的功能精准医学研究。关于数据质量评估指标、缺失值情况、批次效应、样本量充分性、技术重复或验证实验等信息，源站未提供。使用时应结合 BioProject 记录中的原始描述及关联数据自行判断适用性。
【引用与许可】
该数据集来源于 NCBI BioProject，编号为 PRJNA635573。关于具体的引用格式、作者列表、发表文献、数据使用许可或分发限制，源站未提供。使用该数据集时，应遵循 NCBI 及 BioProject 的相关使用条款，并建议查阅源站记录以获取最新的引用与许可信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA635573
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
髓母细胞瘤（MB）是儿童中最常见的恶性脑肿瘤之一。近期研究已确定该疾病至少存在四个亚组，它们在分子特征和患者预后方面各不相同。尽管存在这种异质性，大多数MB患者仍接受相似的治疗，包括手术、放疗和强化化疗。虽然这些治疗延长了生存期，但许多患者仍死于该疾病，而幸存者则承受着治疗带来的严重长期副作用。我们假设每位MB患者对不同的治疗敏感，根据患者肿瘤的分子和细胞特征来定制治疗将改善预后。为验证这一点，我们组建了一组原位患者来源异种移植瘤（PDX），并对其进行了DNA测序、基因表达谱分析和高通量药物筛选。DNA测序分析表明，大多数MB并不具有指向有效疗法的可操作突变。相比之下，基因表达和药物反应数据为每种肿瘤的潜在疗法提供了有价值的信息。
例如，药物筛选表明，放线菌素D——用于治疗肉瘤但很少用于MB——对代表第3组MB（该疾病最具侵袭性的形式）的PDX具有活性。最后，我们表明，肿瘤细胞的功能分析可用于临床环境，以识别比单独测序更多的治疗选择。这些研究表明，有可能摆脱一刀切的方法，开始用对患者肿瘤有效的疗法治疗每位患者。总体设计：我们分析了来自20个PDX样本和7个原发肿瘤的RNA。阵列数据处理未进行技术重复。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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