PRJNA573743：胶质母细胞瘤与正常脑来源内皮细胞的表达数据

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PRJNA573743：胶质母细胞瘤与正常脑来源内皮细胞的表达数据

PRJNA573743 数据集收录于 NCBI，属于肿瘤 / 脑肿瘤分类，主题标签为转录组或基因表达。该数据集比较了胶质母细胞瘤来源的 CD31 阳性内皮细胞（TECs）与正常脑来源内皮细胞（NECs）在明胶单层培养条件下的基因表达差异，检测平台为 Affymetrix Human Genome U219 Array（HG-U219）。整体设计共分析 9 个样本，其中 6 个为 TECs、3 个为 NECs，可用于观察肿瘤相关内皮细胞与正常脑内皮细胞之间的转录表达区别。

【数据集背景】

胶质母细胞瘤是脑肿瘤研究中的重要对象，其微环境中的内皮细胞与正常脑组织内皮细胞在表型和基因表达上可能存在差异。该数据集围绕这一比较问题展开，聚焦于从胶质母细胞瘤组织分离的 CD31 阳性细胞（即 TECs）与从正常脑组织分离的内皮细胞（即 NECs）。两类细胞均以明胶单层培养方式维持，随后进行表达谱检测。数据集的主题标签为 Transcriptome or Gene expression，说明其核心内容是转录组或基因表达层面的测量结果，而非基因组变异、蛋白表达或代谢物数据。该数据集适合作为脑肿瘤内皮细胞转录特征研究的公开表达数据资源。

【数据内容】

数据集包含基因表达数据，检测平台为 Affymetrix Human Genome U219 Array（HG-U219）。整体设计共分析 9 个样本，其中 6 个样本为胶质母细胞瘤来源的 CD31 阳性内皮细胞（TECs），3 个样本为正常脑来源内皮细胞（NECs）。样本分组体现了肿瘤来源内皮细胞与正常脑内皮细胞之间的对照关系。数据内容以基因表达测量为主，未提供其他类型的数据说明。关于具体基因数量、表达值分布、差异表达分析结果、注释文件版本等信息，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，英文名称为“PRJNA573743: Expression data from isolated endothelial cells from glioblastoma and normal brain cultured as monolayer on gelatin”。样本材料为从胶质母细胞瘤和正常脑组织中分离的内皮细胞，培养方式为明胶单层培养。TECs 以 CD31 阳性作为分离标志，NECs 为正常脑来源内皮细胞。检测使用 Affymetrix Human Genome U219 Array（HG-U219）。关于样本采集的具体临床信息、患者数量、组织来源细节、培养时间、RNA 提取方法、芯片杂交与扫描流程等，源站未提供。

【适用场景】

该数据集可用于研究胶质母细胞瘤相关内皮细胞与正常脑内皮细胞之间的基因表达差异，适合作为脑肿瘤微环境、肿瘤血管生成及内皮细胞转录特征研究的参考数据。由于包含 TECs 与 NECs 两组样本，可用于组间表达谱比较、候选基因筛选、通路层面的探索性分析，也可作为相关体外细胞模型表达数据的对照参考。主题标签表明其适用于转录组或基因表达分析场景。关于该数据集在特定疾病分型、预后判断或药物响应预测中的直接用途，源站未提供。

【使用方法】

使用该数据集时，可依据样本分组信息将 6 个 TECs 样本与 3 个 NECs 样本进行对照比较，围绕基因表达水平开展差异分析或描述性分析。由于检测平台为 Affymetrix Human Genome U219 Array（HG-U219），分析时需采用与该平台匹配的芯片注释信息进行基因映射。样本量较小，分析结果宜作为探索性发现，并结合其他数据或实验进行验证。关于原始数据文件格式、预处理流程、归一化方法、质量控制标准及分析软件建议，源站未提供。

【质量与限制】

该数据集的样本总数为 9 个，其中 TECs 6 个、NECs 3 个，组间样本量不完全均衡，统计推断时需注意样本量限制。数据仅涉及明胶单层培养条件下的内皮细胞表达谱，未涵盖其他培养条件或体内环境的信息。关于测序或芯片数据质量参数、重复样本一致性、批次信息、差异表达显著性阈值等，源站未提供。使用时应结合具体研究目的谨慎解释结果，避免过度外推。

【引用与许可】

该数据集来自 NCBI，源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于数据集的引用方式、作者信息、发表文献、数据许可条款及使用限制，源站未提供。使用或再分发数据前，应访问源站页面核实相关引用与许可要求。