PRJNA498500:新辅助抗PD-1免疫治疗促进复发性胶质母细胞瘤生存获益并引发瘤内与全身免疫反应
该数据集来自 NCBI BioProject(编号 PRJNA498500),主题为复发性胶质母细胞瘤的新辅助抗PD-1免疫治疗研究,涉及瘤内与全身免疫反应及生存获益

基本信息
资源简介
PRJNA498500:新辅助抗PD-1免疫治疗促进复发性胶质母细胞瘤生存获益并引发瘤内与全身免疫反应
PRJNA498500 对应一项围绕复发性胶质母细胞瘤新辅助抗 PD-1 免疫治疗的研究数据集合,源站标题指向“新辅助抗 PD-1 免疫治疗促进生存获益并伴随瘤内与全身免疫反应”。该数据集收录于 NCBI BioProject,编号为 498500,本站将其归入肿瘤 / 脑肿瘤分类,主题标签为转录组或基因表达。整体来看,该数据集服务于探索复发性胶质母细胞瘤患者在接受新辅助抗 PD-1 免疫治疗后,肿瘤局部与全身免疫反应变化及其与生存获益之间关系的研究方向,为相关转录组或基因表达数据的发现、链接与再利用提供入口。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject,编号 PRJNA498500。BioProject 是围绕单一研究计划或倡议汇集生物数据的记录,通常来源于单一机构或联合体,旨在为用户提供一个统一入口,以便查找该项目所产生的多种数据类型。该项目的主题聚焦于复发性胶质母细胞瘤的新辅助抗 PD-1 免疫治疗,关注该治疗方式是否促进生存获益,以及是否伴随瘤内和全身免疫反应。本站将其分类为肿瘤 / 脑肿瘤,主题标签为转录组或基因表达,说明该项目所涉及的数据类型与基因表达或转录组层面相关。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”,表明其数据内容与转录组或基因表达相关。源站描述指出,BioProject 记录本身提供的是指向该项目所生成多种数据类型的链接入口,而非单一类型数据的完整集合。因此,该数据集在 BioProject 中的角色是汇总与链接围绕复发性胶质母细胞瘤新辅助抗 PD-1 免疫治疗研究产生的数据。关于具体样本数量、测序平台、表达矩阵、差异基因列表或免疫反应指标等细节,源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,记录类型为 BioProject,编号 498500。其英文名称明确指向一项关于复发性胶质母细胞瘤新辅助抗 PD-1 免疫治疗的研究,涉及生存获益以及瘤内与全身免疫反应。BioProject 作为来源平台,负责汇集与单一研究倡议相关的生物数据,并来源于单一组织或联合体。关于样本采集地点、时间跨度、患者入组标准、伦理审批信息或具体实验流程,源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与复发性胶质母细胞瘤、新辅助抗 PD-1 免疫治疗、肿瘤免疫反应以及转录组或基因表达相关的数据检索与再利用场景。研究人员可通过该 BioProject 记录定位到围绕该研究计划所产生的多种数据类型,进而探索瘤内与全身免疫反应和生存获益之间的潜在关联。由于主题标签明确指向转录组或基因表达,该数据集也可用于寻找基因表达层面的数据入口。关于具体分析流程、统计方法或临床终点定义,源站未提供。
【使用方法】
使用者可通过 NCBI BioProject 平台,以编号 PRJNA498500 或相关英文名称进行检索,获取该项目的记录页面。BioProject 记录的设计目的是为用户提供一个统一位置,以便找到该项目所生成的不同数据类型链接。因此,使用方法上应先访问该 BioProject 记录,再根据页面所提供的链接进一步获取转录组或基因表达相关数据。关于数据下载格式、访问权限、是否需要申请、配套分析工具或预处理步骤,源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来源于 NCBI BioProject,属于项目层面的记录,主要提供数据链接与汇总信息,而非直接提供完整的实验数据或分析结果。其主题标签为转录组或基因表达,但具体数据质量、样本量、测序深度、覆盖度、批次效应或验证程度等信息,源站未提供。此外,该记录描述的是围绕复发性胶质母细胞瘤新辅助抗 PD-1 免疫治疗的研究计划,关于该研究的完整结论、统计显著性、临床转化价值或独立验证情况,源站未提供。使用时应结合原始数据来源和相应研究文献进行判断。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov,记录编号为 PRJNA498500。关于该数据集的引用格式、许可条款、使用限制、商业用途规定或再分发要求,源站未提供。使用者如需引用或再利用,应访问 NCBI BioProject 对应记录页面,查看该平台及项目方发布的相关政策与说明。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载,适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档,适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务(收技术服务费,非数据销售)
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管,完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站:https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA498500
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
胶质母细胞瘤是成人中最常见的原发性恶性脑肿瘤,与较差的生存率相关。标准治疗的化疗和放疗带来的中位总生存期不足两年。Ivy基金会早期临床试验联盟开展了一项随机、多机构临床试验,旨在评估35例复发、可手术切除的胶质母细胞瘤患者在接受帕博利珠单抗(一种程序性细胞死亡蛋白1(PD-1)单克隆抗体)新辅助和/或辅助治疗后的免疫反应和生存情况。随机分配接受新辅助帕博利珠单抗治疗并在术后继续辅助治疗的患者,与随机分配仅接受术后辅助PD-1阻断治疗的患者相比,总生存期显著延长(风险比 = 0.39;P = 0.04,对数秩检验)。新辅助PD-1阻断与肿瘤内T细胞和干扰素-γ相关基因的上调相关,但细胞周期相关基因下调,这在仅接受辅助治疗的患者中未见。
在肿瘤微环境中,程序性死亡配体1(PD-L1)的局灶性诱导在新辅助治疗组中比仅在辅助治疗的患者肿瘤中更常见。同样,新辅助帕博利珠单抗与克隆性T细胞扩增、肿瘤与血液之间T细胞受体的重叠、T细胞中PD-1表达降低以及外周单核细胞群体减少相关。这些发现表明,新辅助给予PD-1阻断可增强局部和全身抗肿瘤免疫反应,并可能代表一种治疗这种一致致死性脑肿瘤的更有效方法。该试验已在ClinicalTrials.gov注册,标识符为NCT02852655(https://clinicaltrials.gov/ct2/show/NCT02852655)。总体设计:该数据集包含复发性胶质母细胞瘤的转录组,其
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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