胶质瘤干细胞原位纵向采样揭示原发肿瘤形成与复发中7号染色体获得和10号染色体丢失的重复事件（表达）
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 393730），标题为胶质瘤干细胞原位详细纵向采样，揭示7号染色体获得和10号染色体丢失是原发肿瘤形成与复发中的重复事件，属于表达类数据
基本信息
资源简介
胶质瘤干细胞原位纵向采样揭示原发肿瘤形成与复发中7号染色体获得和10号染色体丢失的重复事件（表达）
该数据集为 NCBI BioProject 收录的一项表达类研究项目，编号 PRJNA393730，英文标题为“Detailed Longitudinal Sampling of Glioma Stem Cells In Situ Reveals Chr7 Gain and Chr10 Loss As Repeated Events in Primary Tumor Formation and Recurrence (expression)”。从标题可以看出，该研究围绕胶质瘤干细胞的原位纵向采样展开，重点关注7号染色体获得与10号染色体丢失在原发肿瘤形成及复发过程中的重复出现。数据集归属于肿瘤与脑肿瘤分类，主题标签为转录组或基因表达，来源站点为 ncbi.nlm.nih.gov。整体而言，该数据集提供了与胶质瘤干细胞纵向表达研究相关的生物项目入口，便于用户定位和获取该项目所产生的表达类数据。
【数据集背景】
该数据集来自 NCBI BioProject，项目编号为 393730，对应物种为 Homo sapiens。BioProject 是围绕某一项研究计划而汇集生物数据的集合，通常来源于单一机构或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口，用以查找该项目所产生的多种数据类型。该项目的标题明确指向胶质瘤干细胞的原位详细纵向采样研究，并聚焦于7号染色体获得和10号染色体丢失在原发肿瘤形成与复发中的重复事件。因此，该数据集在背景上属于肿瘤学、尤其是脑肿瘤相关的基础研究数据资源，其表达类数据特征与转录组或基因表达主题直接相关。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其内容属于转录组或基因表达类数据。项目标题中包含“(expression)”标识，进一步说明该 BioProject 记录所关联的数据类型涉及基因表达。数据集分类为肿瘤 / 脑肿瘤，说明其研究对象与肿瘤、特别是脑部肿瘤相关。标题中提及的胶质瘤干细胞、原位纵向采样、7号染色体获得、10号染色体丢失、原发肿瘤形成与复发等要素，构成了该项目表达数据所依托的生物学背景。除上述信息外，关于具体样本数量、测序平台、表达矩阵、差异基因列表等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Homo sapiens (ID 393730) - BioProject - NCBI”。项目编号为 PRJNA393730，属于 NCBI BioProject 数据库中的记录。BioProject 作为生物数据的汇集入口，其记录本身并不一定直接包含全部原始数据，而是提供指向该项目所生成的不同数据类型的链接。该项目的物种信息为 Homo sapiens，研究内容涉及胶质瘤干细胞的原位纵向采样。关于具体的采样地点、采样时间跨度、样本处理流程、测序机构或研究者信息，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于与胶质瘤干细胞、脑肿瘤形成与复发相关的表达研究场景。由于主题标签为转录组或基因表达，用户可将其用于查找或分析该 BioProject 下的基因表达数据。标题中强调的7号染色体获得和10号染色体丢失作为原发肿瘤形成与复发中的重复事件，提示该数据可能适用于研究染色体拷贝数变化与基因表达之间的关系，或用于探索胶质瘤复发过程中的分子特征。此外，该数据集也可作为肿瘤 / 脑肿瘤分类下的表达类资源，供转录组分析、生物信息学流程测试或元数据检索等用途。关于具体的分析工具、参考基因组版本或标准化流程，源站未提供。
【使用方法】
用户可通过 NCBI BioProject 记录（ID 393730）访问该数据集，并利用 BioProject 提供的统一入口查找该项目关联的多种数据类型。由于该记录的主题标签为转录组或基因表达，用户可在项目页面中定位表达类数据相关链接。具体的数据下载方式、文件格式、分析软件、参数设置及操作步骤，源站未提供。建议用户依据 NCBI BioProject 的通用导航功能，结合项目标题与主题标签，自行查找可用的表达数据文件或相关资源。
【质量与限制】
该数据集为 NCBI BioProject 记录，其质量与完整性取决于源站所汇集的该项目数据。当前可确认的信息包括项目编号、物种、标题、分类、主题标签及来源站，但关于样本量、测序深度、数据完整性、批次效应、技术重复、生物学重复、数据预处理程度等质量相关指标，源站未提供。此外，该记录为表达类数据，标题中涉及的染色体获得与丢失事件属于项目研究结论，并非该数据集直接提供的全部数据内容。用户在使用时应注意区分项目描述与具体数据文件，并依据源站提供的实际数据评估其适用性。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Homo sapiens (ID 393730) - BioProject - NCBI”。关于该数据集的引用方式、许可协议、使用限制或版权声明，源站未提供。用户在使用该数据集时，应遵循 NCBI 及 BioProject 的相关通用政策，并依据源站页面所展示的信息进行引用。由于源站未提供具体的引用格式或许可条款，建议用户直接访问该 BioProject 记录以获取最新信息。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA393730
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
在本研究中，我们通过从初次诊断时以及患者去世后肿瘤复发时大脑远端多个肿瘤区域生成多克隆和单克隆胶质瘤干细胞系，为GBM病例构建了一个广泛的数据集。我们的分析揭示了复发肿瘤中新克隆的组织广泛扩展，以及7号染色体增益和10号染色体丢失是原发性和复发性疾病中反复出现的基因组事件。此外，尽管肿瘤之间存在其他高度异质性和分歧的基因组改变，7号染色体增益和10号染色体丢失在原发性和复发性肿瘤中产生了相似的mRNA表达谱变化。我们确定了ETV1和CDK6作为可能的候选基因，以及NFKB（复合体）、IL1B、IL6、Akt和VEGF作为潜在的信号调节因子，可能是chr7增益和chr10丢失的潜在中心下游效应器。最后，7号染色体增益和10号染色体丢失后转录组变化引起的差异与大规模患者肿瘤数据集中GBM样本相较于正常大脑通常观察到的差异一致。
总体设计：按照制造商说明，对从患者肿瘤和细胞系中提取的DNA进行了Affymetrix U133P2芯片分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
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