PRJNA283229：Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre 肿瘤与人 AT/RT 相似基因表达谱
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 283229），主题为转录组或基因表达，属于肿瘤与脑肿瘤方向。数据围绕 Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre 小鼠肿瘤与人 AT/RT 的基因表达特征比较，可用于研究两类样本在表达谱上的相似性，并支持肿瘤分型、差异表达分析或表达谱分类等任务
基本信息
资源简介
PRJNA283229：Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre 肿瘤与人 AT/RT 相似基因表达谱
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 283229），英文名称为“PRJNA283229: Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre tumors and human AT/RT show similar gene expression signatures”，源站标题为“Mus musculus (ID 283229) - BioProject - NCBI”。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，本站分类归入肿瘤 / 脑肿瘤方向。数据围绕 Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre 小鼠肿瘤与人 AT/RT 的基因表达特征比较展开，可用于研究两类样本在表达谱上的相似性，并支持肿瘤分型、差异表达分析或表达谱分类等任务。整体而言，该数据集属于转录组或基因表达层面的肿瘤研究资源，来源为 NCBI BioProject，适合关注脑肿瘤表达谱比较的研究者参考使用。
【数据集背景】
该数据集属于 NCBI BioProject 体系下的一个项目记录。BioProject 是围绕某一项研究计划或计划集合而组织的生物数据集合，通常来自单一机构或联合体。BioProject 记录为用户提供一个统一入口，以便查找该项目所产生的多种数据类型。该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明其核心数据类型与转录组或基因表达相关。本站将其分类为肿瘤 / 脑肿瘤，表明其研究背景与肿瘤学、尤其是脑肿瘤方向相关。数据集名称直接点明其研究关注点：Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre 小鼠肿瘤与人 AT/RT 之间相似的基因表达特征。这一背景信息为理解该数据集的用途提供了基本框架。
【数据内容】
该数据集的内容围绕基因表达特征展开，具体涉及 Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre 小鼠肿瘤与人 AT/RT 两类样本的表达谱比较。主题标签“Transcriptome or Gene expression”表明数据属于转录组或基因表达层面。数据集名称中的“similar gene expression signatures”提示其核心发现或研究目标在于揭示两类样本在表达特征上的相似性。因此，数据内容可用于分析两类样本在表达谱上的对应关系，并支持后续的肿瘤分型、差异表达分析或表达谱分类等任务。关于样本数量、测序平台、具体基因列表、表达矩阵细节等信息，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Mus musculus (ID 283229) - BioProject - NCBI”。其英文名称中包含 PRJNA283229，表明这是 NCBI BioProject 下的一个项目编号。源站描述指出，BioProject 是围绕单一研究计划或联合体产生的生物数据集合，记录本身提供统一入口以链接该项目生成的不同数据类型。该数据集来自 NCBI BioProject（ID 283229），主题为转录组或基因表达，属于肿瘤与脑肿瘤方向。关于具体采集方法、实验设计、样本处理流程、测序深度、建库方式等信息，源站未提供。
【适用场景】
根据该数据集的主题与名称，其适用场景包括：研究 Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre 小鼠肿瘤与人 AT/RT 在基因表达特征上的相似性；支持肿瘤分型分析；支持差异表达分析；支持表达谱分类任务。由于主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，该数据集可用于转录组层面的比较研究。本站分类为肿瘤 / 脑肿瘤，因此适合脑肿瘤相关表达谱研究。关于具体分析流程、统计方法、验证实验等，源站未提供。
【使用方法】
该数据集可通过 NCBI BioProject 记录（ID 283229）进行访问和链接，以查找该项目产生的多种数据类型。用户可依据 BioProject 提供的统一入口，获取与转录组或基因表达相关的数据资源。由于数据集名称涉及小鼠肿瘤与人 AT/RT 的表达特征比较，使用者可围绕两类样本的表达谱相似性开展分析。关于具体下载方式、文件格式、数据处理步骤、软件工具等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于公共数据库记录。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，本站分类为肿瘤 / 脑肿瘤。关于数据质量指标、样本量、测序深度、覆盖度、批次效应、技术重复、生物学重复、数据完整性等信息，源站未提供。该数据集名称中提及“similar gene expression signatures”，但关于相似性的具体统计结果、显著性水平、差异表达基因数量等，源站未提供。使用者应结合源站记录自行评估数据适用性。
【引用与许可】
该数据集的来源站为 ncbi.nlm.nih.gov，源站标题为“Mus musculus (ID 283229) - BioProject - NCBI”。关于引用方式、许可协议、使用条款、数据共享政策等信息，源站未提供。使用者应参考 NCBI BioProject 记录及相关页面获取引用与许可要求。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA283229
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
人类髓母细胞瘤（MB）可根据基因表达模式分为四大类：Hedgehog（HH）亚型、Wnt亚型、第3组和第4组。然而，它们与非典型畸胎样/横纹肌样瘤（AT/RT）的基因表达谱存在显著差异。我们重新分析了已发表的儿童脑肿瘤基因表达微阵列数据集，以识别能够清晰区分人类AT/RT与人类MB的基因表达谱。我们利用这一表达谱，仅选择具有明确小鼠直系同源基因的基因，将Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre小鼠（C57Bl/6品系背景）的肿瘤与Ptc1+/-小鼠（C57Bl/6和129Sv混合品系背景）的MB进行比较。Snf5F/Fp53L/LGFAP-Cre肿瘤与小鼠MB明显不同，且区分人类AT/RT与人类MB的标志物同样能区分小鼠肿瘤。总体设计：使用Affymetrix Mouse Genome 430 2.0微阵列平台，对来自5个AT/RT和5个髓母细胞瘤小鼠肿瘤的RNA进行分析。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
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