胶质母细胞瘤细胞对 Cucurbitacin B 的转录组响应：细胞周期与 DNA 复制改变
该数据集来自 NCBI BioProject（ID 1529686），主题为胶质母细胞瘤细胞对 Cucurbitacin B 的转录组响应，揭示细胞周期与 DNA 复制相关改变
基本信息
资源简介
胶质母细胞瘤细胞对 Cucurbitacin B 的转录组响应：细胞周期与 DNA 复制改变
该数据集为 NCBI BioProject 收录的转录组研究项目，编号 1529686，英文名称为“Transcriptomic Response of Glioblastoma Cells to Cucurbitacin B Reveals Alterations in Cell Cycle and DNA Replication”。从名称可以看出，该研究聚焦于胶质母细胞瘤细胞在 Cucurbitacin B 处理后的转录组响应，并揭示细胞周期与 DNA 复制相关改变。数据集在分类上归属于肿瘤 / 脑肿瘤方向，主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其核心数据为基因表达层面的转录组信息。该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，属于 BioProject 体系下的一个项目记录，旨在汇集与单一研究计划相关的多种生物数据类型，便于用户集中查找和访问。
【数据集背景】
该数据集所属的 BioProject 体系是 NCBI 用于组织生物数据的项目框架，一个 BioProject 记录对应一个由单一机构或联盟发起的研究计划，并为用户提供统一入口，以链接该项目产生的不同类型数据。本数据集对应的研究计划围绕胶质母细胞瘤细胞展开，关注其对 Cucurbitacin B 的转录组响应，并指向细胞周期与 DNA 复制相关改变这一生物学主题。胶质母细胞瘤属于脑肿瘤范畴，因此该数据集在分类上被归入肿瘤 / 脑肿瘤方向。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，说明项目产生的数据类型与转录组或基因表达相关。
【数据内容】
该数据集的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。数据集名称明确指出，研究内容为胶质母细胞瘤细胞对 Cucurbitacin B 的转录组响应，并揭示细胞周期与 DNA 复制相关改变。因此，从项目描述来看，数据应涉及处理后细胞在基因表达层面的变化，且这些变化与细胞周期和 DNA 复制过程相关。除上述信息外，关于具体样本数量、测序平台、数据文件类型、表达矩阵或差异基因列表等细节，源站未提供。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，具体为 NCBI BioProject 下的项目记录，ID 为 1529686。其英文名称为“Transcriptomic Response of Glioblastoma Cells to Cucurbitacin B Reveals Alterations in Cell Cycle and DNA Replication”。源站标题显示为“Transcriptomic Response of Glioblastoma Cells to C... (ID 1529686) - BioProject - NCBI”。关于样本采集的具体方法、实验处理条件、测序或检测手段、时间地点及执行机构等信息，源站未提供。
【适用场景】
基于该数据集的主题标签“Transcriptome or Gene expression”以及其研究主题，该数据集适用于与胶质母细胞瘤细胞转录组响应相关的研究场景，尤其是关注 Cucurbitacin B 处理后细胞周期与 DNA 复制改变的分析。由于该数据集归属于肿瘤 / 脑肿瘤分类，也可用于脑肿瘤相关转录组数据的检索与整合。此外，作为 BioProject 记录，它可用于查找和链接该研究计划产生的多种数据类型。关于更具体的适用场景，如药物机制研究、靶点筛选或临床转化等，源站未提供。
【使用方法】
该数据集为 NCBI BioProject 项目记录，用户可通过 NCBI BioProject 体系访问该项目，并借助记录中提供的链接查找该项目产生的不同类型数据。BioProject 记录的设计目的即在于为用户提供单一入口，以定位与某一研究计划相关的多样数据。关于具体的数据下载方式、分析流程、软件工具或代码等，源站未提供。
【质量与限制】
该数据集来自 NCBI BioProject，属于公开的生物数据项目记录。其主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，研究主题明确为胶质母细胞瘤细胞对 Cucurbitacin B 的转录组响应及细胞周期与 DNA 复制相关改变。关于数据质量评估、样本量、重复数、测序深度、覆盖度、批次效应或验证实验等信息，源站未提供。因此，在使用该数据集时，应结合源站记录进一步确认其数据组成与适用范围。
【引用与许可】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov，为 NCBI BioProject 项目记录，ID 为 1529686。关于该数据集的引用方式、许可条款或使用限制，源站未提供。
下载信息
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需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
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公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
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使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1529686
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
胶质母细胞瘤（GBM）是一种侵袭性强、高度增殖的原发性脑肿瘤，治疗选择有限。葫芦素B（CuB）是一种具有生物活性的四环三萜类化合物，已显示出强效的抗肿瘤活性，但其对GBM细胞转录组景观的影响仍未完全明确。本研究对人GBM细胞系LN229在暴露于CuB或溶剂对照后进行了bulk RNA测序。差异表达分析鉴定出1，154个显著改变的基因，包括515个上调基因和639个下调基因。基因本体论和KEGG通路分析显示，细胞周期调控、DNA复制和有丝分裂进程通路显著富集。在差异表达基因中，GADD45A显著上调，而PCNA——DNA复制机器的关键组分——显著下调。这些转录组变化通过RT-qPCR进一步验证，并与功能和分子分析相结合。
RNA测序数据集提供了CuB处理过的GBM细胞的转录谱，并支持GADD45A相关的细胞应激、细胞周期停滞和DNA复制相关反应参与CuB的抗肿瘤活性。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
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