基本信息

模态

基因组

任务类型

分类

创建/更新时间

2026-10-20

资源简介

胶质母细胞瘤中促进少突胶质前体样细胞分化与静息的候选通路

PRJNA144543 是一个收录于 NCBI BioProject 数据库的研究项目，其英文名称为“Candidate pathways for promoting differentiation and quiescence of oligodendrocyte progenitor-like cells in glioblastoma”。该项目以 Mus musculus 为研究对象，主题标签为转录组或基因表达，在本地分类中归属于肿瘤 / 脑肿瘤方向。从标题可以看出，该项目关注胶质母细胞瘤中类少突胶质前体细胞的命运调控，探索促进其分化与静息的候选通路。项目记录本身是 NCBI BioProject 体系中的一个条目，用于汇集与同一研究计划相关的多种数据类型，并提供统一的访问入口。以下从背景、内容、来源、适用场景、使用方法、质量与限制、引用与许可等方面进行介绍。

【数据集背景】

BioProject 是 NCBI 提供的一种项目级记录形式，用于汇集由单一机构或联合体发起的同一项研究计划所产生的生物学数据。一个 BioProject 记录为用户提供单一入口，以便找到该项目所生成的不同类型数据的链接。PRJNA144543 正是这样一个项目记录，其研究对象为 Mus musculus，所属分类为肿瘤 / 脑肿瘤，主题标签为转录组或基因表达。项目标题指向胶质母细胞瘤中类少突胶质前体细胞的分化与静息相关候选通路，说明该项目围绕这一生物学问题组织数据。

【数据内容】

该项目的主题标签为“Transcriptome or Gene expression”，表明其数据内容属于转录组或基因表达范畴。项目标题涉及胶质母细胞瘤中类少突胶质前体细胞的分化与静息候选通路，因此数据应围绕这一研究主题展开。关于具体的样本数量、测序平台、数据文件格式、数据量大小等细节，源站未提供。

【采集与来源】

该数据集来源于 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov，项目编号为 144543。研究对象为 Mus musculus。BioProject 记录本身并不直接包含原始数据文件，而是提供指向该项目所生成的不同类型数据的链接。关于样本采集的具体地点、时间、处理方法以及实验设计细节，源站未提供。

【适用场景】

该数据集适用于肿瘤 / 脑肿瘤领域的研究，尤其是与胶质母细胞瘤相关的转录组或基因表达分析。项目标题所指向的类少突胶质前体细胞分化与静息候选通路，可能适合用于探索该细胞状态调控机制、筛选潜在通路或与其他表达数据进行比较分析。关于更具体的适用场景，源站未提供。

【使用方法】

用户可通过 NCBI BioProject 记录访问该项目，并借助记录中提供的链接获取该项目所生成的不同类型数据。由于 BioProject 记录提供单一入口以查找相关数据链接，使用者可据此定位到转录组或基因表达数据。关于数据下载、处理和分析的具体步骤，源站未提供。

【质量与限制】

该项目为 NCBI BioProject 记录，其描述说明 BioProject 是汇集单一研究计划相关生物学数据的集合，并提供统一访问入口。关于数据质量指标、覆盖度、批次效应、样本代表性等具体信息，源站未提供。使用者应注意，BioProject 记录本身是项目级元数据入口，具体数据质量需结合其链接的原始数据进一步判断。

【引用与许可】

该数据集来源于 NCBI BioProject，源站为 ncbi.nlm.nih.gov。关于该项目的具体引用方式、许可条款或使用限制，源站未提供。

原始链接

https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE30626

访问原始数据

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使用方式

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA144543

标准获取流程：

访问源站链接，注册/登录账号；
进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
- ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
- 天池: 登录后页面提供直链下载
  以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

成熟的中枢神经系统包含PDGFRA+的“少突胶质前体细胞”(OPC)，这些细胞可能保持静息状态、增殖或分化为少突胶质细胞。在人类胶质瘤中，常观察到类似OPC的快速增殖的Olig2+细胞。我们旨在体内识别OPC分化或静息所特有的候选途径。利用bacTRAP方法，我们生成并分析了小鼠品系，用于正常小鼠大脑中主要细胞类型（包括OPC）的翻译谱分析。随后，我们对Pdgf驱动胶质瘤小鼠模型中的少突胶质（Olig2+）细胞进行了谱分析。该分析证实，Olig2+肿瘤细胞与OPC最为相似，但同时揭示了关键祖细胞基因的差异——这些是促进分化或静息的候选基因。总体设计：此处包含两个数据集。一个描述了神经元、星形胶质细胞、成熟和未成熟少突胶质细胞的正常翻译谱。每种细胞类型均从至少两只小鼠的混合样本中进行三次重复分析，并平行收集总RNA对照。

第二个数据集包含了来自几种胶质瘤小鼠模型变体中Olig2阳性细胞的翻译谱。每种变体至少收集了三份样本，并平行分析了总RNA对照。所有翻译谱均采用翻译核糖体亲和纯化方案生成。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别