PRJNA1436467：连续筛选的侵袭性与亲本患者来源胶质母细胞瘤干样细胞RNA-seq图谱
该数据集来自NCBI，包含在3D条件下培养的患者来源胶质母细胞瘤干样细胞的RNA测序图谱。研究者通过transwell侵袭实验连续筛选获得高侵袭性亚群，并与亲本群体进行比较，从而识别与胶质母细胞瘤细胞稳定侵袭表型相关的转录差异
基本信息
资源简介
PRJNA1436467：连续筛选的侵袭性与亲本患者来源胶质母细胞瘤干样细胞RNA-seq图谱
该数据集为来自 NCBI 的 RNA-seq 数据集，英文名称为 PRJNA1436467: RNA-seq profiling of serially selected invasive and parental patient-derived glioblastoma stem-like cells，本站归类于肿瘤 / 脑肿瘤方向，主题标签为 Transcriptome or Gene expression。数据集包含在 3D 条件下培养的患者来源胶质母细胞瘤干样细胞的 RNA 测序图谱。研究者利用 transwell 侵袭实验进行连续筛选，获得高侵袭性亚群，并将其与亲本群体进行比较，以识别与胶质母细胞瘤细胞稳定侵袭表型相关的转录差异。该数据集为研究胶质母细胞瘤侵袭相关转录程序提供了表达谱层面的资料。
【数据集背景】
胶质母细胞瘤是脑肿瘤研究中的重要对象，患者来源的胶质母细胞瘤干样细胞常被用于体外研究。该数据集关注这类细胞在 3D 培养条件下的基因表达特征，特别是与侵袭能力相关的表型。源站描述指出，研究者通过 transwell 侵袭实验的连续筛选，从患者来源细胞中获得了高侵袭性亚群，并将其与亲本群体进行对比。这一设计旨在揭示与稳定侵袭表型相关的转录差异，为理解胶质母细胞瘤细胞侵袭行为的分子基础提供数据支持。
【数据内容】
数据集的核心内容是 RNA 测序图谱，覆盖患者来源胶质母细胞瘤干样细胞在 3D 条件下培养后的转录组信息。数据中比较了两类群体：一是经 transwell 侵袭实验连续筛选得到的高侵袭性亚群，二是相应的亲本群体。主题标签为 Transcriptome or Gene expression，表明数据主要用于转录组或基因表达层面的分析。通过两组群体的表达谱比较，可识别与稳定侵袭表型相关的转录差异。除上述内容外，源站未提供关于样本数量、测序平台、读长、表达矩阵格式等更细化的数据内容说明。
【采集与来源】
该数据集来源于 ncbi.nlm.nih.gov。源站描述说明，样本为患者来源的胶质母细胞瘤干样细胞，在 3D 条件下培养；高侵袭性亚群通过 transwell 侵袭实验连续筛选产生，并与亲本群体进行比较。数据类型为 RNA 测序图谱。关于样本采集的具体临床信息、培养条件的详细参数、筛选轮次、测序建库方法等，源站未提供。
【适用场景】
该数据集适用于转录组或基因表达相关研究，尤其是围绕胶质母细胞瘤细胞侵袭表型的分析。可用于比较高侵袭性亚群与亲本群体之间的基因表达差异，识别与稳定侵袭表型相关的转录特征；也可作为脑肿瘤干细胞样细胞 3D 培养条件下表达谱研究的参考数据。由于主题标签为 Transcriptome or Gene expression，其典型用途包括差异表达分析、转录程序比较等。源站未提供该数据集在其他具体应用场景中的验证或说明。
【使用方法】
使用该数据集时，可围绕高侵袭性亚群与亲本群体的 RNA-seq 表达谱开展比较分析，以识别与侵袭表型相关的转录差异。具体分析流程、数据文件组织方式、是否提供标准化表达矩阵或原始测序数据等信息，源站未提供。使用者需依据 NCBI 平台上的实际数据组织情况进行获取与处理。
【质量与限制】
源站描述强调该数据集能够识别与胶质母细胞瘤细胞稳定侵袭表型相关的转录差异，但未提供样本量、重复数、测序深度、数据质控指标等质量相关信息。关于数据集的局限性，源站未提供明确说明。该数据集基于患者来源细胞在 3D 条件下的体外培养与连续筛选，其结论的外推范围需结合具体研究设计判断，源站未就此展开。
【引用与许可】
源站未提供该数据集的引用方式与许可信息。使用时应遵循 NCBI 平台的相关规定，具体引用要求与许可条款需以源站页面信息为准。
下载信息
注册下载
需要注册 Kaggle 账号并登录后下载，适合需要跟踪下载记录和使用 API 的用户。
暂未开放公开下载
无需注册即可直接获取公开样本或文档，适合快速预览和评估数据集质量。
免登录有偿下载
公开数据集受托下载与技术交付服务。
提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取
源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1436467
标准获取流程：
- 访问源站链接，注册/登录账号；
- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
该数据集包含在3D条件下培养的患者来源的胶质母细胞瘤干细胞样细胞的RNA测序图谱。通过使用transwell侵袭实验连续筛选，生成了一种高度侵袭性的亚群，并将其与亲本群体进行了比较。该数据集有助于识别与胶质母细胞瘤细胞中稳定侵袭表型相关的转录差异。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
数据缺失？
依托陕西、四川两大基地，我们与超过十家三甲医院建立直接合作关系，覆盖合规授权、采集治理、专业标注、数据交付的全流程，为AI医疗团队提供即拿即用的高质量临床数据。
⚡️ 需要数据支持或标注服务？立即联系我们获取专业方案。
