PRJNA1226123：Ca-α1T与Slo敲低果蝇胶质瘤模型RNA-seq

数据集获取

源站：https://ncbi.nlm.nih.gov/bioproject/PRJNA1226123

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

该数据集呈现了黑腹果蝇胶质瘤模型的转录组图谱，旨在探究Ca-α1T和Slo基因敲低对基因表达的影响。样本由解剖的果蝇头部组成。所用胶质瘤模型基于Read等人2009年的研究（《PLOS Genetics》），该研究通过在胶质细胞中共过表达激活型dEGFR（dEGFRλ）和dp110（dp110CAAX）建立了果蝇胶质瘤模型（Read等，2009）。本工作得到了西班牙科学与创新部资助的研究项目“Programa Generación de Conocimiento PID2022-138688OB-I00”的支持。总体设计：数据集包含以下条件：对照组、胶质瘤组、胶质瘤×Ca-α1T-RNAi组和胶质瘤×Slo-RNAi组。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。