聚丙烯酰胺基底黏度对胶质母细胞瘤细胞中替莫唑胺活性的影响：流式细胞术与流变学测量

数据集获取

源站：https://doi.org/10.34808/x509-nx16

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数据说明

数据集包含经替莫唑胺处理的细胞系LN-229和LN-18的原始数据，这些数据通过流式细胞术、流变学和细胞投影测量获得。数据集还包括基于发表于《Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Basis of Disease》的论文“Substrate viscosity impairs temozolomide-mediated inhibition of glioblastoma cells’ growth”中图表制作及基于这些图表的结论所必需的计算。在中枢神经系统(CNS)病理发展及细胞对药物反应的过程中，脑细胞外环境的机械状态对其表型有显著影响。对几种脑肿瘤的粘弹性特性研究显示，组织刚度和粘度可能在疾病进展过程中发生变化。尽管大量研究表明基质刚度对脑癌细胞的增殖、运动和药物敏感性有影响，但关于基质粘度变化的相关证据却相对匮乏。

基于对大鼠脑样本黏弹性的应变流变学测量，合成了与组织弹性和黏性特征相匹配的聚丙烯酰胺（PAA）水凝胶。由于基底黏度增加，利用光学显微镜和流式细胞术评估了胶质母细胞瘤细胞形状、增殖以及抗癌药物替莫唑胺（TMZ）细胞毒性的变化。基底黏度的变化对未处理胶质瘤细胞的增殖影响较小，但对线粒体凋亡相关去极化和DNA片段化程度有较大影响。这表明，用于检测黏度和刚度的装置可能激活胶质瘤细胞中不同的信号通路。根据所收集的数据，在用于药物筛选的体外聚合物基细胞培养系统中，黏度应被视为一个重要特征。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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