患者来源胶质瘤干细胞类器官

数据集获取

源站：https://clinicaltrials.gov/study/NCT04868396

标准获取流程：

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   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
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     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

疾病：胶质母细胞瘤。胶质母细胞瘤（GM）患者的中位总生存期约为15个月。GM的标准治疗包括最大程度的手术切除，随后进行放疗和使用替莫唑胺（TMZ）的化疗（1）。无论初始肿瘤反应如何，肿瘤复发都不可避免，复发后生存期降至不足6个月。针对可能驱动原发肿瘤主体生长的癌基因的GM定制化方法迄今在临床试验中尚未取得成功（2），这造成了巨大的未满足需求，亟需新方法来克服对当前治疗方案的原发性和获得性耐药。本研究的目标是建立来源于GM患者的原代类器官培养物，以研究导致原发性和复发性GM侵袭性肿瘤生长和治疗耐药的机制。1. 胶质母细胞瘤的瘤间和瘤内异质性。针对GM的肿瘤定制化方法受到GM细胞微环境和基因组改变的瘤间和瘤内异质性的阻碍。已有研究表明，肿瘤由携带不同遗传改变的多个克隆组成（3-7）。

克隆演化模型认为，肿瘤形成始于起源细胞，随后积累多种遗传和表观遗传改变，从而赋予肿瘤细胞生存和生长优势（8）。早期转化细胞中出现的差异性遗传改变，在肿瘤微环境的选择性压力下产生了多种克隆（3-7）。一个重要的微环境应激因素是瘤内缺氧，这在GM中很常见，并且是与生存期缩短相关的负面预后和预测因素（9,10）。新出现的证据表明，具有正常干细胞特征的肿瘤细胞亚群——即所谓的胶质瘤干细胞（GSC）——参与了内在性和获得性治疗耐药。GSC具有特定特性，包括高肿瘤起始能力

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。