IPD-Brain：印度组织病理学胶质瘤亚型分类数据集

数据集获取（Figshare）

• 源站标题：IPD-Brain: An Indian histopathology dataset for glioma subtype classification
• DOI：10.6084/m9.figshare.27186087.v2
• 发布日期：2024-10-11
• 文件数：3 个
• 文件总体积：12.16 GB
• 源站页面：https://figshare.com/articles/dataset/IPD_Brain/27186087

命令行下载

curl -L -o "IPD_Brain.csv" "https://ndownloader.figshare.com/files/49656543"
curl -L -o "Unlabeled.zip" "https://ndownloader.figshare.com/files/49727925"
curl -L -o "labelled.zip" "https://ndownloader.figshare.com/files/49728021"

文件清单

• IPD_Brain.csv（94.91 KB）
• Unlabeled.zip（1.39 GB）
• labelled.zip（10.77 GB）

文件总体积 12.16 GB（源站 API 实测）。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

IPD-Brain数据集是一个综合性集合，包含来自367名患者的547张高分辨率H&E染色切片，旨在推动胶质瘤亚型和免疫组化（IHC）生物标志物的研究。该数据集是亚洲同类数据集中规模最大的之一，尤其值得关注的是其聚焦于印度人群的多样人口特征。每张切片均以40倍放大倍数扫描，并在一个xlsx文件中包含详细的临床注释，如患者年龄、性别、影像学表现、诊断、CNS WHO分级以及IHC生物标志物状态，涵盖IDH1 R132H、ATRX、p53和增殖指数Ki67。IPD-Brain数据集开放使用并受伦理准则约束，旨在促进从训练机器学习模型到探索疾病区域和种族差异的广泛应用。该数据集的更高分辨率版本（最高40倍放大倍数）可从data foundation下载，请访问以下链接：https://india-data.org/dataset-details/170acc68-1288-499e-9a91-b951e569e70d

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.27186087.v2（source: https://figshare.com/articles/dataset/IPD_Brain/27186087）。