高通量药物筛选与高内涵分析数据集：跨异质性患者来源胶质母细胞瘤干细胞模型的综合药理学调查
该数据集来自 datashare.ed.ac.uk，提供 384 孔微孔板格式的高通量、高内涵药物筛选数据，基于图像读出
基本信息
资源简介
高通量药物筛选与高内涵分析数据集：跨异质性患者来源胶质母细胞瘤干细胞模型的综合药理学调查
该数据集来自 datashare.ed.ac.uk，提供 384 孔微孔板格式的高通量、高内涵药物筛选数据，基于图像读出。筛选针对 6 种胶质瘤干细胞系，使用多个药物库，涵盖已批准和临床前化合物。数据包括 CellProfiler 流程输出的定量图像分析结果：原始数据与处理后数据（特征重缩放/变换、冗余特征去除、对 DMSO 归一化），并附元数据及相关板图/信息。可用于药物反应预测、表型分析及胶质母细胞瘤干细胞模型中的药理学研究（来源 datashare.ed.ac.uk）。
【数据内容】
源站描述（机器翻译，仅供参考）：384 孔微孔板格式的高通量、高内涵药物筛选数据，基于图像读出。筛选针对 6 种胶质瘤干细胞系，使用多个药物库，涵盖已批准和临床前化合物。数据集包括 CellProfiler 流程输出的定量图像分析：原始数据和处理后数据（特征重缩放/变换、冗余特征去除、对 dmso 归一化），包括元数据和相关板图/信息
【主题与分类】
主题标签：High throughput drug screening、High content analysis、Cell Painting、Phenotypic analysis、Drug Screening、Glioblastoma、Glioma stem cells、drug combinations。本站分类：肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面：https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/9113
下载信息
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数据集获取
源站：https://datashare.ed.ac.uk/handle/10283/9113
标准获取流程：
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- 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
- 部分平台提供 SDK，例如：
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据说明
384孔微孔板格式的高通量、高内涵药物筛选数据，源自基于图像的读出。筛选针对6种胶质瘤干细胞系，使用多种药物库，包括已批准和临床前化合物。数据集包含来自CellProfiler管道输出的定量图像分析：原始数据和处理数据（特征重缩放/转换、去除冗余特征、对DMSO归一化），以及元数据和相关板图/信息。
数据加载示例（图像类）
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。
需要用于商业化训练或医疗器械注册（NMPA/FDA）？
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托三甲直采网络，提供合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。
