PPARα抑制对头颈部副神经节瘤细胞的影响

该数据集来自 plos.figshare.com,配套 PLOS ONE 2017 年论文,围绕 PPARα 抑制对头颈部副神经节瘤(HNPGL)细胞的影响

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2023-05-30 更新
浏览 1
蛋白质预测neck paraganglioma cells Headcell cycle arrestWYHNPGL treatment needPI 3K pathwayHNPGL cell viabilityGW 6471GW 6471 treatmentCDKHNPGL cellsPPARcyclin B 1 protein expression
Effects of PPARα inhibition in head and neck paraganglioma cells

基本信息

模态
蛋白质
大小
0.000293939 GB
任务类型
预测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2023-05-30
版本
v1

资源简介

PPARα抑制对头颈部副神经节瘤细胞的影响

Effects of PPARα inhibition in head and neck paraganglioma cells

该数据集来自 plos.figshare.com,配套 PLOS ONE 2017 年论文,围绕 PPARα 抑制对头颈部副神经节瘤(HNPGL)细胞的影响。数据包含 8 个 Excel 表格文件(S1 至 S8 Table),涉及 HNPGL 细胞模型、PPARα 免疫反应性、细胞活力、细胞周期阻滞、CDK 与 cyclin B1 蛋白表达以及 PI3K 通路等实验内容。可用于探索 PPARα 作为 HNPGL 治疗靶点的潜力,并支持对相关分子机制与候选化合物的分析(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Effects of PPARα inhibition in head and neck paraganglioma cells》发表于 PLOS ONE(2017),DOI:10.1371/journal.pone.0178995。源站首次发布:2017-06-08。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):头颈部副神经节瘤(HNPGLs)是罕见肿瘤,因其倾向于浸润颅底而可能造成重要并发症。目前手术是唯一的治疗选择,但根治性切除可能困难或不可行。因此,需要确定 HNPGL 治疗的有效靶点和分子。然而,这种罕见肿瘤缺乏细胞模型阻碍了这一任务。PPARα 受体激活已在多种肿瘤中被报道,该受体似乎是不同恶性肿瘤中有前景的治疗靶点。考虑到 PPARα 在 HNPGLs 中的作用此前从未被研究,我们在一个独特的 HNPGL 细胞模型中分析了调节 PPARα 的潜力。我们观察到 HNPGL 肿瘤中 PPARα 的强烈免疫反应性,提示该受体在 HNPGL 中具有重要作用。在 HNP 中也证实了 PPARα 的显著核表达

【数据结构与技术规格】

文件数 8 个,合计 293.94 KB。数据集 DOI:10.1371/journal.pone.0178995。

【主题与分类】

源站学科分类:Biophysics、Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Pharmacology。主题标签:neck paraganglioma cells Head、cell cycle arrest、WY、HNPGL treatment need、PI 3K pathway、HNPGL cell viability、GW 6471、GW 6471 treatment、CDK、HNPGL cells。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Biophysics、Biochemistry、Cell Biology、Genetics、Molecular Biology、Pharmacology。

【获取与许可】

源站页面:https://plos.figshare.com/articles/dataset/Effects_of_PPAR_inhibition_in_head_and_neck_paraganglioma_cells/5096302

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Florio, Rosalba; De Lellis, Laura; di Giacomo, Viviana; Di Marcantonio, Maria Carmela; Cristiano, Loredana; Basile, Mariangela; et al. (2017). Effects of PPARα inhibition in head and neck paraganglioma cells. PLOS ONE. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2023-05-30,引用时请注意版本时效。

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curl -L -o "S6 Table.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/8648392"
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curl -L -o "S8 Table.xlsx" "https://ndownloader.figshare.com/files/8648398"

文件清单

  • S1 Table.xlsx(47.08 KB)
  • S2 Table.xlsx(34.68 KB)
  • S3 Table.xlsx(37.09 KB)
  • S4 Table.xlsx(30.12 KB)
  • S5 Table.xlsx(36.76 KB)
  • S6 Table.xlsx(38.92 KB)
  • S7 Table.xlsx(35.26 KB)
  • S8 Table.xlsx(34.02 KB)

文件总体积 293.94 KB(源站 API 实测)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。

数据说明

头颈部副神经节瘤(HNPGLs)是一种罕见肿瘤,因其倾向于浸润颅底,可能导致严重的并发症。目前,手术是唯一的治疗选择,但彻底切除可能困难或无法实现。因此,需要确定HNPGL治疗的有效靶点和分子。然而,这种罕见肿瘤缺乏细胞模型,阻碍了这一任务的完成。据报道,PPARα受体在多种肿瘤中被激活,该受体似乎在不同恶性肿瘤中是一个有前景的治疗靶点。考虑到PPARα在HNPGL中的作用此前从未被研究过,我们在一个独特的HNPGL细胞模型中分析了调控PPARα的潜力。我们观察到HNPGL肿瘤中PPARα的强烈免疫反应性,提示该受体在HNPGL中具有重要作用。在HNPGL来源的细胞中也证实了PPARα的明显核表达。特异性PPARα激动剂WY14643对HNPGL细胞活力无影响,而特异性PPARα拮抗剂GW6471通过诱导细胞周期阻滞和caspase依赖性凋亡,降低了HNPGL细胞的活力和生长。

GW6471处理与HNPGL细胞中CDK4、cyclin D3和cyclin B1蛋白表达的显著降低以及p21表达的增加相关。此外,GW6471显著损害了HNPGL细胞的克隆形成活性,对细胞迁移的影响则较不明显。值得注意的是,GW6471对HNPGL细胞的作用与PI3K/GSK3β/β-catenin信号通路的抑制相关。总之,PPARα拮抗剂GW6471降低HNPGL细胞活力,干扰细胞周期并诱导凋亡。影响HNPGL细胞活力的机制涉及对PI3K/GSK3β/β-catenin通路的抑制。因此,PPARα可能成为HNPGL的一个新的治疗靶点。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.1371/journal.pone.0178995(source: https://plos.figshare.com/articles/dataset/Effects_of_PPAR_inhibition_in_head_and_neck_paraganglioma_cells/5096302)。

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