二维纳米材料药物载体筛选的可复现GFN2-xTB与对接及无泄漏QSAR流程数据集
该数据集收录了 Perspective 文章的四幅手稿图与跨系统汇总数据集,配套完整可复现流程(图生成器、跨仓库数据聚合脚本及手稿生成器)归档于 GitHub 对应发布版本

基本信息
资源简介
二维纳米材料药物载体筛选的可复现GFN2-xTB与对接及无泄漏QSAR流程数据集
Don't Fool Yourself When Screening 2D-Nanomaterial Drug Carriers: A Reproducible GFN2-xTB + Docking + Leak-Free QSAR Pipeline, Four Disease Case Studies, and a Cautionary Tale
该数据集收录了 Perspective 文章的四幅手稿图与跨系统汇总数据集,配套完整可复现流程(图生成器、跨仓库数据聚合脚本及手稿生成器)归档于 GitHub 对应发布版本。内容源自四个独立纳米 QSAR 案例研究,均采用同一可复现的 GFN2-xTB + 对接 + 无泄漏 QSAR 流程:KRAS-G12D/g-C3N4、胶质母细胞瘤/MXene、TNBC/B36N36 纳米笼及阿尔茨海默病 Tau/硼烯。各系统完整代码、精选数据集与计算输出分别归档于各自仓库与 Zenodo 存档。可用于纳米材料药物载体筛选的方法学验证与可复现性研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 Inter。
【数据集背景】
源站首次发布:2026。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本记录保存了 Perspective 文章《Don't Fool Yourself When Screening 2D-Nanomaterial Drug Carriers》的 4 幅手稿图与跨系统汇总数据集,该文已投稿至 Beilstein Journal of Nanotechnology。完整、完全可复现的流程(图生成器、跨仓库数据聚合脚本及手稿生成器本身)归档于 GitHub 对应发布版本: Perspective 从四个独立纳米 QSAR 案例研究中提炼方法学教训,这些案例均使用同一可复现的 GFN2-xTB + 对接 + 无泄漏 QSAR 流程构建:KRAS-G12D/g-C3N4、胶质母细胞瘤/MXene、TNBC/B36N36 纳米笼及阿尔茨海默病 Tau/硼烯。各系统自身的完整代码、精选数据集与计算输出分别归档于各自仓库与 Zenodo 存档(DOIs 10.5281
【主题与分类】
主题标签:2D Nanomaterials、Drug Delivery、QSAR/QSPR Validation、GFN2-xTB、Molecular Docking、Reproducibility、Data Leakage。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.22760388
使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。
下载信息
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使用方式
数据集获取
源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.22760388
标准获取流程:
- 访问源站链接,注册/登录账号;
- 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
- 部分平台提供 SDK,例如:
- OpenDataLab:
pip install openxlab后openxlab.dataset.get(...) - ModelScope:
pip install modelscope后modelscope download - 天池: 登录后页面提供直链下载
以源站「数据下载/使用文档」页面为准。
- OpenDataLab:
数据集大小约 3.2 MB。
数据说明
本记录保存了投稿至Beilstein Journal of Nanotechnology的Perspective文章《Don’t Fool Yourself When Screening 2D-Nanomaterial Drug Carriers》的4幅手稿插图及跨系统汇总数据集。完整且完全可复现的流程(插图生成器、跨仓库数据聚合脚本及手稿生成器本身)已归档于GitHub上对应的发布版本:https://github.com/sircalch/methods-pipeline-2d-nanocarriers/releases/tag/v1.0.1。该Perspective文章从四项独立的纳米定量构效关系(nano-QSAR)案例研究中提炼出一条方法论经验,这些研究均采用同一套可复现的GFN2-xTB + 分子对接 + 无泄漏QSAR流程构建:KRAS-G12D/g-C3N4、胶质母细胞瘤/MXene、TNBC/B36N36纳米笼以及阿尔茨海默病Tau/硼烯。每个系统各自的完整代码、精选数据集及计算结果均归档于其各自的代码仓库和Zenodo存储库(DOI:10.5281/zenodo.22187819、22187857、22187834、22187873)。
数据加载示例(图像类)
from PIL import Image
import glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)
# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path) # 要求 子目录=类别
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