二维纳米材料药物载体筛选的可复现GFN2-xTB与对接及无泄漏QSAR流程数据集

该数据集收录了 Perspective 文章的四幅手稿图与跨系统汇总数据集,配套完整可复现流程(图生成器、跨仓库数据聚合脚本及手稿生成器)归档于 GitHub 对应发布版本

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其他预测2D NanomaterialsDrug DeliveryQSAR/QSPR ValidationGFN2-xTBMolecular DockingReproducibilityData Leakage
Don't Fool Yourself When Screening 2D-Nanomaterial Drug Carriers: A Reproducible GFN2-xTB + Docking + Leak-Free QSAR Pipeline, Four Disease Case Studies, and a Cautionary Tale

基本信息

模态
其他
大小
0.003160795 GB
任务类型
预测
许可
Creative Commons Attribution 4.0 International
创建/更新时间
2026-10-18
版本
v1.0.1

资源简介

二维纳米材料药物载体筛选的可复现GFN2-xTB与对接及无泄漏QSAR流程数据集

Don't Fool Yourself When Screening 2D-Nanomaterial Drug Carriers: A Reproducible GFN2-xTB + Docking + Leak-Free QSAR Pipeline, Four Disease Case Studies, and a Cautionary Tale

该数据集收录了 Perspective 文章的四幅手稿图与跨系统汇总数据集,配套完整可复现流程(图生成器、跨仓库数据聚合脚本及手稿生成器)归档于 GitHub 对应发布版本。内容源自四个独立纳米 QSAR 案例研究,均采用同一可复现的 GFN2-xTB + 对接 + 无泄漏 QSAR 流程:KRAS-G12D/g-C3N4、胶质母细胞瘤/MXene、TNBC/B36N36 纳米笼及阿尔茨海默病 Tau/硼烯。各系统完整代码、精选数据集与计算输出分别归档于各自仓库与 Zenodo 存档。可用于纳米材料药物载体筛选的方法学验证与可复现性研究(来源 DOI 解析,Creative Commons Attribution 4.0 Inter。

【数据集背景】

源站首次发布:2026。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):本记录保存了 Perspective 文章《Don't Fool Yourself When Screening 2D-Nanomaterial Drug Carriers》的 4 幅手稿图与跨系统汇总数据集,该文已投稿至 Beilstein Journal of Nanotechnology。完整、完全可复现的流程(图生成器、跨仓库数据聚合脚本及手稿生成器本身)归档于 GitHub 对应发布版本: Perspective 从四个独立纳米 QSAR 案例研究中提炼方法学教训,这些案例均使用同一可复现的 GFN2-xTB + 对接 + 无泄漏 QSAR 流程构建:KRAS-G12D/g-C3N4、胶质母细胞瘤/MXene、TNBC/B36N36 纳米笼及阿尔茨海默病 Tau/硼烯。各系统自身的完整代码、精选数据集与计算输出分别归档于各自仓库与 Zenodo 存档(DOIs 10.5281

【主题与分类】

主题标签:2D Nanomaterials、Drug Delivery、QSAR/QSPR Validation、GFN2-xTB、Molecular Docking、Reproducibility、Data Leakage。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【获取与许可】

源站页面:https://zenodo.org/doi/10.5281/zenodo.22760388

使用许可:Creative Commons Attribution 4.0 International。

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源站:https://doi.org/10.5281/zenodo.22760388

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  1. 访问源站链接,注册/登录账号;
  2. 进入数据集详情页,按页面指引申请权限或直接下载;
  3. 部分平台提供 SDK,例如:
    • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
    • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
    • 天池: 登录后页面提供直链下载
      以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据集大小约 3.2 MB。

数据说明

本记录保存了投稿至Beilstein Journal of Nanotechnology的Perspective文章《Don’t Fool Yourself When Screening 2D-Nanomaterial Drug Carriers》的4幅手稿插图及跨系统汇总数据集。完整且完全可复现的流程(插图生成器、跨仓库数据聚合脚本及手稿生成器本身)已归档于GitHub上对应的发布版本:https://github.com/sircalch/methods-pipeline-2d-nanocarriers/releases/tag/v1.0.1。该Perspective文章从四项独立的纳米定量构效关系(nano-QSAR)案例研究中提炼出一条方法论经验,这些研究均采用同一套可复现的GFN2-xTB + 分子对接 + 无泄漏QSAR流程构建:KRAS-G12D/g-C3N4、胶质母细胞瘤/MXene、TNBC/B36N36纳米笼以及阿尔茨海默病Tau/硼烯。每个系统各自的完整代码、精选数据集及计算结果均归档于其各自的代码仓库和Zenodo存储库(DOI:10.5281/zenodo.22187819、22187857、22187834、22187873)。

数据加载示例(图像类)

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

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