儿童脑肿瘤免疫相关八基因特征预后数据

该数据集来自scielo.figshare.com,配套论文研究儿童脑肿瘤(PBT)免疫相关八基因特征的预后意义。数据基于Pediatric Brain Tumor Atlas: CBTTC队列,包含2个表格文件(Table_1.xls、Table_2.xls),可用于分析基因表达特征与患者生存预后

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2024-02-06 更新
浏览 11
基因组预测Pediatric brain tumorGene signatureOverall survivalPrognosisBiomarkers
Data from: Prognostic implications of immune-related eight-gene signature in pediatric brain tumors

基本信息

模态
基因组
大小
0.00001536 GB
任务类型
预测
许可
CC BY 4.0
创建/更新时间
2024-02-06
版本
v1

资源简介

儿童脑肿瘤免疫相关八基因特征预后数据

Prognostic implications of immune-related eight-gene signature in pediatric brain tumors

该数据集来自scielo.figshare.com,配套论文研究儿童脑肿瘤(PBT)免疫相关八基因特征的预后意义。数据基于Pediatric Brain Tumor Atlas: CBTTC队列,包含2个表格文件(Table_1.xls、Table_2.xls),可用于分析基因表达特征与患者生存预后的关联,涉及Kaplan-Meier分析、Cox回归、LASSO建模、ROC曲线、GSEA及免疫浸润分析等方法,服务于儿童脑肿瘤预后生物标志物挖掘与风险预测研究(来源 figshare,CC BY 4.0 许可)。

【数据集背景】

配套论文《Prognostic implications of immune-related eight-gene signature in pediatric brain tumors》发表于 Brazilian Journal of Medical and Biological Research(2021),DOI:10.1590/1414-431x2020e10612。源站首次发布:2022-06-02。

【数据内容】

源站描述(机器翻译,仅供参考):基因组研究为儿童脑肿瘤(PBT)的分子亚群和致癌驱动因素提供了见解,可能带来新的治疗策略。队列Pediatric Brain Tumor Atlas: CBTTC(CBTTC队列)的参与者被随机分为训练队列和验证队列。在训练队列中,应用Kaplan-Meier分析和单变量Cox回归模型对预后基因进行初步筛选。实施LASSO Cox回归模型构建多基因特征,随后通过Kaplan-Meier、Cox和受试者工作特征曲线(ROC)分析在验证队列和CBTTC队列中进行验证。此外,进行基因集富集分析(GSEA)和免疫浸润分析,以了解功能注释和该特征在肿瘤微环境中的作用。构建了一个八基因特征,该特征 wa

【数据结构与技术规格】

文件数 2 个,合计 15.36 KB。数据集 DOI:10.6084/m9.figshare.19962676.v1。

【主题与分类】

源站学科分类:Medicine、Microbiology not elsewhere classified。主题标签:Pediatric brain tumor、Gene signature、Overall survival、Prognosis、Biomarkers。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。

【适用方向】

源站学科分类标注为 Medicine、Microbiology not elsewhere classified。

【获取与许可】

源站页面:https://scielo.figshare.com/articles/dataset/Prognostic_implications_of_immune-related_eight-gene_signature_in_pediatric_brain_tumors/19962676

使用许可:CC BY 4.0(https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/)。

规范引用:Wang, Yi; Zhou, Chuan; Luo, Huan; Cao, Jing; Ma, Chao; Cheng, Lulu; et al. (2021). Prognostic implications of immune-related eight-gene signature in pediatric brain tumors. SciELO journals. Dataset

【使用注意】

· 源站最后修改于 2024-02-06,引用时请注意版本时效。

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使用方式

数据集获取(Figshare)

命令行下载

curl -L -o "Table_1.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/35532613"
curl -L -o "Table_2.xls" "https://ndownloader.figshare.com/files/35532616"

文件清单

  • Table_1.xls(9.73 KB)
  • Table_2.xls(5.63 KB)

文件总体积 15.36 KB(源站 API 实测)。

数据说明

基因组研究为儿童脑肿瘤(PBT)的分子亚群和致癌驱动因素提供了见解,可能促成新的治疗策略。儿童脑肿瘤图谱队列(CBTTC队列)的参与者被随机分为训练队列和验证队列。在训练队列中,采用Kaplan-Meier分析和单因素Cox回归模型对预后基因进行初步筛选。实施LASSO Cox回归模型构建多基因特征,随后通过Kaplan-Meier、Cox和受试者工作特征曲线(ROC)分析在验证队列和CBTTC队列中进行验证。此外,还进行了基因集富集分析(GSEA)和免疫浸润分析,以了解功能注释及该特征在肿瘤微环境中的作用。构建了一个八基因特征,通过Kaplan-Meier分析检验,显示无论在训练队列还是验证队列中均存在显著的总体生存差异。通过Cox回归分析进一步证明,该八基因特征独立于其他临床病理参数。

此外,ROC分析表明,该特征对PBT预后具有更好的预测能力。进一步,GSEA和免疫浸润分析显示,该特征与免疫相关通路存在密切相互作用,并与肿瘤环境中的CD8 T细胞和单核细胞密切相关。识别八基因特征(CBX7、JADE2、IGF2BP3、OR2W6P、PRAME、TICRR、KIF4A和PIMREG)能够准确识别患者的预后,且该特征与免疫优势肿瘤环境存在密切相互作用,这可能为PBT患者的个性化预后预测和新疗法提供见解。

许可

CC BY 4.0

引用

学术使用请引用 DOI 10.6084/m9.figshare.19962676.v1(source: https://scielo.figshare.com/articles/dataset/Prognostic_implications_of_immune-related_eight-gene_signature_in_pediatric_brain_tumors/19962676)。

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