2016 WHO 弥漫性胶质瘤分类亚型的 DNA 甲基化特征补充表 S1
该数据集为论文补充材料,围绕 2016 WHO 弥漫性胶质瘤分类亚型的 DNA 甲基化特征,汇总了各队列的样本量与弥漫性胶质瘤亚型信息,并列出用于 PAM 训练的差异甲基化 CpG 位点,包括 LGG IDH 突变型与野生型、少突胶质细胞瘤与弥漫性星形细胞瘤、GBM IDH 突变型与野生型之间的比较

基本信息
资源简介
2016 WHO 弥漫性胶质瘤分类亚型的 DNA 甲基化特征补充表 S1
Additional file 1: Table S1. of DNA methylation signatures for 2016 WHO classification subtypes of diffuse gliomas
该数据集为论文补充材料,围绕 2016 WHO 弥漫性胶质瘤分类亚型的 DNA 甲基化特征,汇总了各队列的样本量与弥漫性胶质瘤亚型信息,并列出用于 PAM 训练的差异甲基化 CpG 位点,包括 LGG IDH 突变型与野生型、少突胶质细胞瘤与弥漫性星形细胞瘤、GBM IDH 突变型与野生型之间的比较,以及测试集与验证集中的甲基化特征位点和不一致样本的分子分析结果。数据可用于胶质瘤分子分型、甲基化标志物筛选与分类模型构建等研究(来源 DOI 解析,CC BY + CC0 许可)。
【数据集背景】
源站首次发布:2017。
【数据内容】
源站描述(机器翻译,仅供参考):本研究使用的各队列的样本量和弥漫性胶质瘤亚型。表 S2. 在训练(TCGA)集中用作 PAM 输入的 LGG IDH 突变型与 WT 之间差异甲基化 CpG 列表。表 S3A. 在测试集(TCGA)和验证集(GSE48462)中用于 LGG IDH 突变型与 IDH WT 的 14 个 CpG 甲基化特征列表。表 S3B. 在测试集(TCGA)和验证集(GSE48462)中用于少突胶质细胞瘤(ODG)与弥漫性星形细胞瘤(DA)的 14 个 CpG 甲基化特征列表。表 S4. 在训练(TCGA)集中用作 PAM 输入的少突胶质细胞瘤与弥漫性星形细胞瘤之间差异甲基化 CpG 列表。表 S5. 在训练(TCGA)集中用作 PAM 输入的 GBM IDH 突变型与 WT 之间 259 个差异甲基化 CpG 探针列表。表 S6. 通过 CpG 甲基化特征识别的不一致样本的分子分析。表 S7A. 分子
【主题与分类】
主题标签:Biochemistry、Space Science、Medicine、Genetics、Developmental Biology、Cancer、Inorganic Chemistry。本站分类:肿瘤/脑肿瘤。
【获取与许可】
源站页面:https://springernature.figshare.com/articles/dataset/Additional_file_1_Table_S1_of_DNA_methylation_signatures_for_2016_WHO_classification_subtypes_of_diffuse_gliomas/4817272
使用许可:CC BY + CC0。
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- OpenDataLab:
数据说明
本研究中所用各队列的样本量及弥漫性胶质瘤亚组。表S2. 在训练集(TCGA)中用作PAM输入的LGG IDH突变型与野生型之间差异甲基化CpG列表。表S3A. 在测试集(TCGA)和验证集(GSE48462)中LGG IDH突变型与IDH野生型之间14个CpG甲基化特征列表。表S3B. 在测试集(TCGA)和验证集(GSE48462)中少突胶质细胞瘤(ODG)与弥漫性星形细胞瘤(DA)之间14个CpG甲基化特征列表。表S4. 在训练集(TCGA)中用作PAM输入的少突胶质细胞瘤与弥漫性星形细胞瘤之间差异甲基化CpG列表。表S5. 在训练集(TCGA)中用作PAM输入的GBM IDH突变型与野生型之间259个差异甲基化CpG探针列表。表S6. 通过CpG甲基化特征识别的不一致样本的分子分析。表S7A. 本研究中使用的TCGA LGG样本中IDH、TP53、ATRX和1p/19q的分子状态。表S7B. 本研究中使用的GSE58218 LGG样本中IDH、TP53、ATRX和1p/19q的分子状态。表S7C.
本研究中使用的GSE48462中LGG样本的IDH、TP53、ATRX和1p/19q分子状态。表S8。本研究中使用的所有数据集中不一致样本的患者ID。表S9A。本研究中使用的TCGA数据集中GBM样本的IDH、TP53、ATRX、EGFR和PTEN分子状态。表S9B。本研究中使用的GSE38278数据集中GBM样本的IDH、TP53、ATRX、EGFR和PTEN分子状态。(ZIP 1601 kb)
需要用于商业化训练或医疗器械注册(NMPA/FDA)?
公开数据往往缺乏完整的病理回证与专家标注。千方医数集依托陕川双基地与超十家三甲医院直连,提供完全合规、去标识化、支持注册级质控的专病数据集交易服务。




