胶质母细胞瘤临床适用连接性特征含肿瘤网络驱动因子CHI3L1

数据集获取

源站：https://omicsdi.org/dataset/pride/PXD044001

标准获取流程：

1. 访问源站链接，注册/登录账号；
2. 进入数据集详情页，按页面指引申请权限或直接下载；
3. 部分平台提供 SDK，例如：
   • OpenDataLab: pip install openxlab 后 openxlab.dataset.get(...)
   • ModelScope: pip install modelscope 后 modelscope download
   • 天池: 登录后页面提供直链下载
     以源站「数据下载/使用文档」页面为准。

数据说明

肿瘤微管（TMs）将胶质瘤细胞连接成网络，对肿瘤进展和治疗耐药性具有重要影响。单个肿瘤中TM互连性的测定一直颇具挑战，其对患者生存的影响也尚未明确。本研究利用染料摄取方法，从单细胞RNA测序（scRNA-Seq）的异种移植原代胶质母细胞瘤（GB）细胞中建立了一个连接性特征，并通过细胞钙信号事件的记录加以确认，且经临床相关性验证。在scRNA-Seq的患者来源异种移植瘤和患者样本中，星形胶质细胞样和间充质样GB细胞的连接性特征评分最高。在大型GB队列中，网络连接性与间充质亚型及患者不良生存相关。CHI3L1被鉴定并验证为连接性的稳健分子标志物，具有功能相关性。该连接性特征为脑肿瘤生物学提供了新见解，原理性证明了肿瘤细胞TM连接性与患者预后相关，并可作为一种稳健的预后生物标志物。

数据加载示例（图像类）

from PIL import Image
import glob, os

files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.png"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.jpg"), recursive=True)
       + glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tif"), recursive=True))
print("图像文件数:", len(files))
img = Image.open(files[0]); print("尺寸/模式:", img.size, img.mode)

# torchvision Dataset 方式:
# from torchvision import datasets
# ds = datasets.ImageFolder(path)  # 要求 子目录=类别

目录组织与标注格式以源站说明和下载后实际文件为准。