drug-seq-u2os-novartis
包含U-2 OS骨肉瘤细胞系经小分子化合物扰动后的转录组表达数据，标注作用机制，适用于药物发现研究。
基本信息
资源简介
drug-seq-u2os-novartis
【数据集背景】
本数据集源站标题为《TitouanCh/drug-seq-u2os-novartis》。源站首次发布：2025-06-20。
【数据内容】
源站原始描述：**I AM NOT AFFILIATED WITH NOVARTIS IN ANY WAY; THIS IS SIMPLY AN UPLOAD OF THEIR DATASET, "NOVARTIS/DRUG-SEQ U2OS MOABOX DATASET # Novartis DRUG-seq U2OS MoABox Dataset This dataset profiles transcriptomic responses of the **U-2 OS** human osteosarcoma cell line to a broad collection of small molecule perturbations. It contains **49,392 observations** spanning **3,742 unique compounds** tested at **4 distinct dosages + `0.0`**, each annotated with their respective **mechanisms of action (MoA…
【数据结构与技术规格】
文件数 353 个，合计 65.02 GB。
【主题与分类】
主题标签：license:mit、size_categories:10K<n<100K、format:parquet、modality:text、modality:timeseries、library:datasets、library:dask、library:mlcroissant、library:polars、region:us。
【适用方向】
结构化表格数据可直接用于统计建模、特征工程与队列分析。
【获取与许可】
源站页面：https://huggingface.co/datasets/TitouanCh/drug-seq-u2os-novartis
使用许可：mit。
【使用注意】
· 源站最后修改于 2025-06-24，引用时请注意版本时效。
下载信息
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提供高速下载与技术交付服务（收技术服务费，非数据销售）
暂未开放当前数据集主要来源为 Kaggle 公开托管，完整影像包建议通过原始链接或 Kaggle API 获取。
使用方式
数据集获取与加载（Hugging Face datasets）
# 前置依赖: pip install datasets
from datasets import load_dataset
ds = load_dataset("TitouanCh/drug-seq-u2os-novartis")
print(ds) # 查看 splits 与字段结构
# 国内网络可先设镜像: import os; os.environ["HF_ENDPOINT"]="https://hf-mirror.com"
git lfs install && git clone https://hf-mirror.com/datasets/TitouanCh/drug-seq-u2os-novartis
数据说明
该数据集包含诺华DRUG-seq U2OS MoABox数据，记录了U-2 OS人类骨肉瘤细胞系经3,742种小分子化合物在4个剂量下扰动后的转录组反应。共49,392个观察值，每个观察值包含59,594个基因的表达数据，并标注了化合物的作用机制（MoA），适用于药物发现研究。
数据加载示例（表格/文本类）
import pandas as pd, glob, os
files = (glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.csv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.tsv"), recursive=True)
+ glob.glob(os.path.join(path, "**", "*.xlsx"), recursive=True))
print("数据文件:", files)
df = pd.read_csv(files[0])
print(df.shape); print(df.columns.tolist()); print(df.head(3))
完整数据卡：huggingface.co/datasets/TitouanCh/drug-seq-u2os-novartis
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