公开可用的膀胱癌数据集

该数据集是一个公开的膀胱癌单细胞RNA测序数据集,包含从SRA数据库获取的单细胞转录组数据,数据模态为基因表达矩阵和细胞注释信息,主要用于膀胱癌的细胞异质性研究、分子分型分析以及单细胞数据分析流程的开发和验证。

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2024-05-06 更新
膀胱癌研究单细胞测序
创建时间2023-07-28
更新时间2024-05-06
原始链接

https://github.com/AndrewGarven/SingleCellSeq

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资源简介

该数据集是一个公开可用的膀胱癌单细胞测序数据集,主要包含从SRA(Sequence Read Archive)数据库获取的单细胞RNA测序数据。数据集涵盖了膀胱癌相关的单细胞转录组数据,通过使用`scanpy`库进行数据检索、预处理和分析,支持从原始数据发现到最终评估的完整工作流程。该数据集主要用于膀胱癌的分子机制研究、细胞亚群鉴定、生物标志物发现以及单细胞数据分析方法的开发和验证。

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